RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDKN3Q16667 212 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HACD2Q6Y1H2 254 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFAP2CQ92754 450 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACDQ96AP0 544 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGFLR1Q9H665 355 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EBF1Q9UH73 591 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.18■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC01553A4QN01 128 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 K7EPI3 171 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E2F3O00716 465 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GAT1O43505 415 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGALP20701 1170 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTGR1Q14914 329 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEDD8Q15843 81 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZSR9 355 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADIPOR2Q86V24 386 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFRP1Q8N474 314 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKFN1Q8N957 763 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEURL2Q9BR09 285 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCD2Q9UBJ2 740 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A8MU76 341 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFXAPO00287 272 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLGAP1O14490 977 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BMP2P12643 396 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC2A4P14672 509 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFC2P35250 354 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC6A11P48066 632 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IST1P53990 364 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBPL2Q6SJ96 375 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FIG4Q92562 907 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANAPC2Q9UJX6 822 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDC14AQ9UNH5 594 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa15.17■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FFAR2O15552 330 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTSLP07711 333 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1SP09871 688 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMOX2P30519 316 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RCAN2Q14206 197 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRIN2CQ14957 1233 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2A12Q8NGT7 310 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO30Q8TB52 745 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNJ9Q92806 393 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BIRC7Q96CA5 298 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP295NLQ96MC4 621 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AQP12BA6NM10 295 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B3GALT4O96024 378 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPNS1P04632 268 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACRV1P26436 265 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEK2P51955 445 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BNIP2Q12982 314 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAPTM5Q13571 262 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLYATQ6IB77 296 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX20Q7Z614 316 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCAIQ8N9R8 606 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPV3Q8NET8 790 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX13Q92968 403 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHID1Q9BWS9 393 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IPPKQ9H8X2 491 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHRS7Q9Y394 339 aa15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAPBPO15533 448 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MATN4O95460 622 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MLYCDO95822 493 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ESR1P03372 595 aa15.15■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSD17B1P14061 328 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.7 ms