RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487251.5

LRRC1-203, Transcript of leucine rich repeat containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRRC1, Length 2,527 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1-203ENST00000487251 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 CEPT1Q9Y6K0 416 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ANKRD28O15084 1053 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ELFN1P0C7U0 828 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 NRIP1P48552 1158 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ACOX1Q15067 660 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 LIPIQ6XZB0 460 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 SPPL2CQ8IUH8 684 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 GALNT4Q8N4A0 578 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 MANBAO00462 879 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ULK1O75385 1050 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 TRMUO75648 421 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 RB1P06400 928 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 DCDC1P59894 354 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 GAB4Q2WGN9 574 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 NEK5Q6P3R8 708 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 SLC32A1Q9H598 525 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 SPINT1O43278 529 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 WDR47O94967 919 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ADH1CP00326 375 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 EBLN1P0CF75 366 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ITPKAP23677 461 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ST8SIA6P61647 398 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PRKG2Q13237 762 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 COQ5Q5HYK3 327 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 CANT1Q8WVQ1 401 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ACTR8Q9H981 624 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 TSPAN6O43657 245 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PREPP48147 710 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 NEK2P51955 445 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 TSPEARQ8WU66 669 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 EYSQ5T1H1 3165 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ABRQ12979 859 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 AP2M1Q96CW1 435 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ARHGAP10A1A4S6 786 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 CFAP99D6REC4 459 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 RGS14O43566 566 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PRAMEF4O60810 478 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 TIPRLO75663 272 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 CLDN9O95484 217 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PDYNP01213 254 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 C8GP07360 202 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 NCK1P16333 377 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 GGT5P36269 586 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 MAGEA8P43361 318 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 GSK3BP49841 420 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ZNF284Q2VY69 593 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 NANOGP8Q6NSW7 305 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 OR2T3Q8NH03 318 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 HSPBAP1Q96EW2 488 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PPP3R2Q96LZ3 170 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ASB16Q96NS5 453 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 NANOGQ9H9S0 305 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 GFYI3L273 518 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 COQ9O75208 318 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 HSD17B1P14061 328 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PSMC3P17980 439 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 HIST1H2ADP20671 130 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 PBX2P40425 430 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 IMPG1Q17R60 797 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRC1-203ENST00000487251 BORAQ6PGQ7 559 aa22.1■■□□□ 1.13
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