RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 SLC30A3Q99726 388 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 GABRG3Q99928 467 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 DERL2Q9GZP9 239 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ABCG8Q9H221 673 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ACSS2Q9NR19 701 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 OLAHQ9NV23 265 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ANAPC2Q9UJX6 822 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 DHRS7Q9Y394 339 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GVG6 124 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PP18 115 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 H0YAE9 185 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 H3BMM5 538 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 UBXN8O00124 270 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 NME4O00746 187 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 PIP5K1BO14986 540 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ARPC2O15144 300 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 TIPRLO75663 272 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 RHOBTB1O94844 696 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CDK14O94921 469 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 SLC4A1P02730 911 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ADRB3P13945 408 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CD1EP15812 388 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CAPGP40121 348 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 RANBP1P43487 201 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CCT8P50990 548 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 MERTKQ12866 999 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 EPS8Q12929 822 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 NFYCQ13952 458 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGEF7Q14155 803 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 RCAN2Q14206 197 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 GK3PQ14409 553 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ANKS6Q68DC2 871 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ERAP2Q6P179 960 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZVL8 140 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 RBFAQ8N0V3 343 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF786Q8N393 782 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CBR4Q8N4T8 237 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CD200R1Q8TD46 325 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 RAB7BQ96AH8 199 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 PTERQ96BW5 349 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ULK4Q96C45 1275 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC58Q96CX6 371 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 RDH12Q96NR8 316 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 GPR21Q99679 349 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 BOCQ9BWV1 1114 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 GALNT8Q9NY28 637 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 AURKCQ9UQB9 309 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR1A-208ENST00000486964 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms