RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 RIPK3Q9Y572 518 aa3.01□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.01□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 LIPGQ9Y5X9 500 aa3.01□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 DUXAA6NLW8 204 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 DNM1LO00429 736 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PLOD2O00469 737 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 SLC22A3O75751 556 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 UMODP07911 640 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PTAFRP25105 342 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PRKCIP41743 596 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 RAB28P51157 221 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PPARDQ03181 441 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PTPRCAPQ14761 206 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 TCP11X2Q5H9J9 407 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 TECRLQ5HYJ1 363 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ARMC4Q5T2S8 1044 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 STPG1Q5TH74 334 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CST9LP1Q5W188 147 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 KRT80Q6KB66 452 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PRR27Q6MZM9 219 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 C19orf48Q6RUI8 117 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 DNAJC22Q8N4W6 341 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CAMKVQ8NCB2 501 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 RDM1Q8NG50 284 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 OR1J1Q8NGS3 322 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 KIF18AQ8NI77 898 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 HSD17B8Q92506 261 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 SLAMF9Q96A28 289 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 HDAC11Q96DB2 347 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ARSGQ96EG1 525 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CFAP57Q96MR6 1250 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 SFXN2Q96NB2 322 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CCDC3Q9BQI4 270 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 KATNB1Q9BVA0 655 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 SLC2A11Q9BYW1 496 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 MMP28Q9H239 520 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 DPP3Q9NY33 737 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ACAD8Q9UKU7 415 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 HEG1Q9ULI3 1381 aa3□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 NEMP2A6NFY4 417 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 AP5Z1O43299 807 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CIDEAO60543 219 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 NGFP01138 241 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 IGHV2-70P01814 119 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CSN3P07498 182 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CD48P09326 243 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CA4P22748 312 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PCGF2P35227 344 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PTGER4P35408 488 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 TIMP3P35625 211 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 MTHFRP42898 656 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 LGALS3BPQ08380 585 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 GAGE5Q13069 117 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 GAGE6Q13070 117 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.932e-11■□□□□ 8
SENP6-208ENST00000483859 ITGA7Q13683 1181 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ZNF273Q14593 569 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 TNIP1Q15025 636 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 GDPD4Q6W3E5 623 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 SLC26A9Q7LBE3 791 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ZNF383Q8NA42 475 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 LRRC8CQ8TDW0 803 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PIGBQ92521 554 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 SPSB1Q96BD6 273 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ZNF524Q96C55 264 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 SIPA1Q96FS4 1042 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 FEVQ99581 238 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 RAD9AQ99638 391 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 EPYCQ99645 322 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 LAT2Q9GZY6 243 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 FKRPQ9H9S5 495 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 MRGBPQ9NV56 204 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa2.99□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 PRR32B1ATL7 298 aa2.98□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 FAM86B1E9PN63 330 aa2.98□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CCL24O00175 119 aa2.98□□□□□ -1.93
SENP6-208ENST00000483859 CLIC2O15247 247 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms