RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465120.3

HOXB3-204, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB3, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-204ENST00000465120 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 MFRPQ9BY79 579 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CASS4Q9NQ75 786 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PAK5Q9P286 719 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 MAP10Q9P2G4 905 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 IQCF5A8MTL0 148 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 DPM1O60762 260 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RPN2P04844 631 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 APOA4P06727 396 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TPBGLP0DKB5 382 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ALAS2P22557 587 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 FOLR3P41439 243 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RAPSNQ13702 412 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SEMA3AQ14563 771 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SLC9A5Q14940 896 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 KIR2DS3Q14952 304 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TMED2Q15363 201 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TTC23LQ6PF05 361 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF534Q76KX8 674 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 KRT222Q8N1A0 295 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 NDC1Q9BTX1 674 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CARD6Q9BX69 1037 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 GPR83Q9NYM4 423 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 MED13Q9UHV7 2174 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PEX12O00623 359 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 HCRTR1O43613 425 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 CD63P08962 238 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 CD97P48960 835 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 RAB28P51157 221 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 SSPNQ14714 243 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 PCID2Q5JVF3 399 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 VRK3Q8IV63 474 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 NUDT9Q9BW91 350 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 LUZP4Q9P127 313 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 CDYLQ9Y232 598 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 NDUFS3O75489 264 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 CTSBP07858 339 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 MAGP20916 626 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 PKLRP30613 574 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 TTPAP49638 278 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 CRADDP78560 199 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 ACVR1Q04771 509 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 IP6K3Q96PC2 410 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 IL17FQ96PD4 163 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXB3-204ENST00000465120 RELNP78509 3460 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms