RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ISM1B1AKI9 464 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H3BMM5 538 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ESR1P03372 595 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADARP55265 1226 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPS2Q13227 327 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GRB7Q14451 532 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF789Q5FWF6 425 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC38A9Q8NBW4 561 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM136AQ96C01 138 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL17FQ96PD4 163 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RUFY1Q96T51 708 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCND3Q9UK17 655 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NFS1Q9Y697 457 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa15.04■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A0J9YY10 115 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C21orf140B9A014 251 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP1O94782 785 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 F7P08709 466 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP2A7P20853 494 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTK6Q13882 451 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIR2DS3Q14952 304 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZIC1Q15915 447 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC5A12Q1EHB4 618 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNSTQ6PJW8 725 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CREG2Q8IUH2 290 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLCO2A1Q92959 643 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM60AQ9NP50 221 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.03■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTAGE9A4FU28 777 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RASGRF2O14827 1237 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1orf105O95561 183 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 S1PR4O95977 384 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHRM3P20309 590 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD9P21926 228 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTGIRP43119 386 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCR10P46092 362 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BDKRB1P46663 353 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ITGA1P56199 1179 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POLE2P56282 527 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTBP1Q13363 440 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERV3-1Q14264 604 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GBX1Q14549 363 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFB110Q30KQ9 67 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFB109BQ30KR1 87 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBTB2Q8N680 514 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MR1Q95460 341 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCTN2Q96GX1 697 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRFN5Q96NI6 719 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACTL8Q9H568 366 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GALPQ9UBC7 116 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.02■□□□□ -0
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COL6A6A6NMZ7 2263 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF462Q96JM2 2506 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT87PA6NCN2 255 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 E5RI56 91 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 E7EQ34 232 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HCRTR1O43613 425 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CREG1O75629 220 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FURINP09958 794 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SFTPCP11686 197 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP5DP30049 168 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RORAP35398 523 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC1A2P43004 574 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GABRA4P48169 554 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPS18P62269 152 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NFATC3Q12968 1075 aa15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms