RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NT5C3BQ969T7 300 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OTUB2Q96DC9 234 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FEM1CQ96JP0 617 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C5orf34Q96MH7 638 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACOX2Q99424 681 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEF6Q9H4E7 631 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEC1Q9P2X7 70 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTGES3LE9PB15 166 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUSKO15146 869 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CACNG3O60359 315 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNTN5O94779 1100 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APODP05090 189 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CISD3P0C7P0 127 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GZMAP12544 262 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCF4P15884 667 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MATN1P21941 496 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMA2P25787 234 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD70P32970 193 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXCR3P49682 368 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALCP54803 685 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NXPH1P58417 271 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPS8Q12929 822 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPPE1Q53F39 396 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FSCBQ5H9T9 825 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM215Q68D42 235 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXL22Q6P050 247 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SZRD1Q7Z422 152 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPXM2Q8N436 756 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALLCQ8N6M5 410 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TERB1Q8NA31 727 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NELL1Q92832 810 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLDN23Q96B33 292 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC38A3Q99624 504 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ISCUQ9H1K1 167 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NENFQ9UMX5 172 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.41□□□□□ -1.06
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 F5H5T6 163 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM72CH0Y354 149 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMPRSS11DO60235 418 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ONECUT2O95948 504 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FESP07332 822 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPARCP09486 303 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COMTP21964 271 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NFKBIAP25963 317 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HLA-FP30511 346 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMB10P40306 273 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MVDP53602 400 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LMAN2Q12907 356 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANGPT1Q15389 498 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.41□□□□□ -1.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.41□□□□□ -1.06
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