RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454323.1

CUL3-208, Transcript of cullin 3, human

TSL 3

Gene CUL3, Length 688 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-208	ENST00000454323	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ASCL1	P50553	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CDO1	Q16878	200 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	HFE	Q30201	348 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	NSMAF	Q92636	917 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	RND1	Q92730	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	MEIS3	Q99687	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CPNE1	Q99829	537 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	GLI3	P10071	1580 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ZFYVE9	O95405	1425 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	HS3ST1	O14792	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TIMM23	O14925	209 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SELENOF	O60613	162 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SOX30	O94993	753 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	MOCS3	O95396	460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	UROS	P10746	265 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	P4HA1	P13674	534 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	GAP43	P17677	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	KCNA5	P22460	613 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CD27	P26842	260 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	STX2	P32856	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	WNT5A	P41221	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PRELP	P51888	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TAS2R38	P59533	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TROAP	Q12815	778 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	NPRL3	Q12980	569 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	RAD54L	Q92698	747 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323		A0A1W2PP11	408 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CUL3-208	ENST00000454323	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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