RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JKAMPQ9P055 326 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NFS1Q9Y697 457 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KMOO15229 486 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSF2BPO75031 334 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHOQP17081 205 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RFC3P40938 356 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDELC1Q6UW63 502 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRLF3Q8IUI8 442 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AMER2Q8N7J2 671 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEMA4DQ92854 862 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMC6Q96SB8 1091 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OVOL3O00110 214 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR10H2O60403 315 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 THBS1P07996 1170 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARSFP54793 590 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABHD13Q7L211 337 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPAS2Q99743 824 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARL15Q9NXU5 204 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GABRA1P14867 456 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCRN2Q96FV2 425 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR2AG1Q9H205 316 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LYSTQ99698 3801 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBR4Q5T4S7 5183 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM77I1YAP6 450 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DSCR3O14972 297 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPP00450 1065 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HLA-DPA1P20036 260 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GGT5P36269 586 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MC3RP41968 323 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GZMKP49863 264 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AP1B1Q10567 949 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CUL2Q13617 745 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC38Q502W7 563 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RILPL1Q5EBL4 403 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MANEALQ5VSG8 457 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MIEF2Q96C03 454 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NTNG2Q96CW9 530 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPY6RQ99463 290 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM51Q9NW97 253 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA1468Q9P260 1216 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLRC4O43908 158 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DAB1O75553 588 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRYGSP22914 178 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1QL4Q86Z23 238 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SULF2Q8IWU5 870 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF611Q8N823 705 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCYL1Q96KG9 808 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIGQQ9BRB3 760 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OCEL1Q9H607 264 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDFQ9HBH1 243 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms