RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 KLKB1P03952 638 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CFIP05156 583 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MMP2P08253 660 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ITGA2BP08514 1039 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SERPINF2P08697 491 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MYL4P12829 197 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CREB1P16220 341 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 DRD4P21917 467 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ADRA1DP25100 572 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CD86P42081 329 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 POLD2P49005 469 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CSRP3P50461 194 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CRADDP78560 199 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TUBA3CQ13748 450 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GRM7Q14831 915 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SLC1A5Q15758 541 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 HHATQ5VTY9 493 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RANBP10Q6VN20 620 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GAREM2Q75VX8 874 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SYT12Q8IV01 421 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 YAF2Q8IY57 180 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CALML6Q8TD86 181 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MGARPQ8TDB4 240 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RHOJQ9H4E5 214 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TREX1Q9NSU2 369 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MID2Q9UJV3 735 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CENPEQ02224 2701 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CACNA1DQ01668 2161 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 DNHD1Q96M86 4753 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 A0A0D9SEW6 157 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PPM1 405 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 E2F8A0AVK6 867 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ZNF197O14709 1029 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TPP1O14773 563 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 KLF11O14901 512 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ATG13O75143 517 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SPAG7O75391 227 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PMPCBO75439 489 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RFPL1O75677 317 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF12O95522 483 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 GSTA1P08263 222 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 HDCP19113 662 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CRHR1P34998 444 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 AVPR1AP37288 418 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CCR10P46092 362 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CCT5P48643 541 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SGSHP51688 502 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SEC24CP53992 1094 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 AP1S1P61966 158 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ARF5P84085 180 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 DSC2Q02487 901 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ACVR1Q04771 509 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 OLIG2Q13516 323 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SLC12A1Q13621 1099 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 BMPR2Q13873 1038 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 POU6F1Q14863 301 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 INSCQ1MX18 579 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MPPE1Q53F39 396 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TXNDC8Q6A555 127 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ANO7Q6IWH7 933 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 HTR3DQ70Z44 454 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 SYT13Q7L8C5 426 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms