RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NFKBIBQ15653 356 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 RFX6Q8HWS3 928 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 OR5AR1Q8NGP9 310 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 DLG3Q92796 817 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 SLC26A1Q9H2B4 701 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF160Q9HCG1 818 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 SEC14L3Q9UDX4 400 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 CRLS1Q9UJA2 301 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GX78 115 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF487B1APH4 448 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 F10P00742 488 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 RALBP11234 206 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 SHMT2P34897 504 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 INAQ16352 499 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 PSMF1Q92530 271 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 C14orf79Q96F83 325 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 FCRL5Q96RD9 977 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 SEMA3GQ9NS98 782 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 PTGFRNQ9P2B2 879 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 CTSFQ9UBX1 484 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL20Q9Y2M5 609 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 DYTNA2CJ06 578 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 HPP00738 406 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ARSFP54793 590 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 STX1AQ16623 288 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 OR13C4Q8NGS5 318 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 COPS8Q99627 209 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ABI3Q9P2A4 366 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 VSTM2BA6NLU5 285 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ISM1B1AKI9 464 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 DSCR3O14972 297 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 AGTP01019 485 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 MCM3P25205 808 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 SOX11P35716 441 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 OR1D4P47884 311 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 TLE4Q04727 773 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 C3AR1Q16581 482 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 PID1Q7Z2X4 250 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 CEP97Q8IW35 865 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF567Q8N184 647 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 DTWD1Q8N5C7 304 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 HAS2Q92819 552 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 C8orf44Q96CB5 159 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 VPS50Q96JG6 964 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 CUTCQ9NTM9 273 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 PLAGL1Q9UM63 463 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 PCNX1Q96RV3 2341 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf81A6NN90 581 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP99D6REC4 459 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 RASAL1O95294 804 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 SERPING1P05155 500 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 MAGP20916 626 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 AGAP20933 346 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 RBPJQ06330 500 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 RPA4Q13156 261 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 MPP3Q13368 585 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 MESDQ14696 234 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF449Q6P9G9 518 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 SIRT6Q8N6T7 355 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ULK4Q96C45 1275 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 CRB3Q9BUF7 120 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 UVRAGQ9P2Y5 699 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 ASF1AQ9Y294 204 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 NEU2Q9Y3R4 380 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN14O95500 239 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 CRYABP02511 175 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 SMSP52788 366 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 FANCCQ00597 558 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 FILIP1LQ4L180 1135 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD12-201ENST00000404162 VSIG1Q86XK7 387 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms