RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 PMS2P3Q13401 168 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PLCL1Q15111 1095 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ENPP6Q6UWR7 440 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 KCTD8Q6ZWB6 473 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 GPR149Q86SP6 731 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ITCHQ96J02 903 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 MUS81Q96NY9 551 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 IKZF5Q9H5V7 419 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.55■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 NUAK1O60285 661 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CST1P01037 141 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PDYNP01213 254 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 EPORP19235 508 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 AOAHP28039 575 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 S100A3P33764 101 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 GBX1Q14549 363 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF773Q6PK81 442 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CALHM3Q86XJ0 350 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PLPP6Q8IY26 295 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 SELENOMQ8WWX9 145 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 EBF1Q9UH73 591 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 NPIPB8E9PQR5 432 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC16A5O15375 505 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 HIST1H2ADP20671 130 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 B4GALNT1Q00973 533 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CREMQ03060 361 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PTSQ03393 145 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB39AQ14964 217 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 GAREM2Q75VX8 874 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 GPR65Q8IYL9 337 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 VOPP1Q96AW1 172 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CMTM7Q96FZ5 175 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 LMLNQ96KR4 655 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A1W2PQ67 120 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ACPPP15309 386 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 SP140Q13342 867 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 THAP5Q7Z6K1 395 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM86B1Q8N7N1 296 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PJA1Q8NG27 643 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 OSBPL10Q9BXB5 764 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ING2Q9H160 280 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 SERTM1A2A2V5 107 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CPNE6O95741 557 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 TCF3P15923 654 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 ASB11Q8WXH4 323 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 TESCQ96BS2 214 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 HPS4Q9NQG7 708 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 GNGT2O14610 69 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 TEX28O15482 410 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CREG1O75629 220 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC6A12P48065 614 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-202ENST00000399409 NKG7Q16617 165 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms