RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.32■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 MOCS1Q9NZB8 636 aa21.32■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PILRAQ9UKJ1 303 aa21.32■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 LAMA5O15230 3695 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 KDM1AO60341 852 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 EBLN1P0CF75 366 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ST6GAL1P15907 406 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 UGT2B7P16662 529 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLTPP55058 493 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC7A5Q01650 507 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CUL1Q13616 776 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 C8orf74Q6P047 294 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPESP1Q6UW49 350 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 NEK10Q6ZWH5 1172 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 LINC01555Q8NAE3 123 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 FBXO25Q8TCJ0 367 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 INPP5DQ92835 1189 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAD51AP1Q96B01 352 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRORYQ9H606 182 aa21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT87PA6NCN2 255 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RASGRF2O14827 1237 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 EFSO43281 561 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 DLGAP3O95886 979 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PVRP15151 417 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF28P17035 718 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CD9P21926 228 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCNFP41002 786 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARL4DP49703 201 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CAV1Q03135 178 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACY1Q03154 408 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 MGAT5Q09328 741 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TUBB3Q13509 450 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TUBB2AQ13885 445 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 BROXQ5VW32 411 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM73Q86UV7 250 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RASGRP3Q8IV61 690 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR2L8Q8NGY9 312 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEC14L1Q92503 715 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 NKD1Q969G9 470 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 FOPNLQ96NB1 174 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 FGF21Q9NSA1 209 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 LHX6Q9UPM6 363 aa21.3■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZFHX4Q86UP3 3567 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 VPS26AO75436 327 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 STK17BO94768 372 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TIAF1O95411 115 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDKN2DP55273 166 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIR2DS3Q14952 304 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTC23LQ6PF05 361 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIF18AQ8NI77 898 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RARRES3Q9UL19 164 aa21.29■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ESYT3A0FGR9 886 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARHGEF33A8MVX0 844 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAD1O60671 282 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPAG6O75602 509 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 MPC1LP0DKB6 136 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SSTR1P30872 391 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 UCNP55089 124 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPR19Q15760 415 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP1R3BQ86XI6 285 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CPNE9Q8IYJ1 553 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RNF31Q96EP0 1072 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CPNE5Q9HCH3 593 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDE7BQ9NP56 450 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSAT1Q9Y617 370 aa21.28■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ISM1B1AKI9 464 aa21.27■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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