RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 SMARCD3Q6STE5 483 aa18.24■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 GHDCQ8N2G8 530 aa18.24■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A075B6Q4 140 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ISM1B1AKI9 464 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 MCIDASD6RGH6 385 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 TLR4O00206 839 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ADAM15Q13444 863 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 GPR152Q8TDT2 470 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CDK15Q96Q40 435 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 FXYD6Q9H0Q3 95 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CST11Q9H112 138 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 EBF1Q9UH73 591 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CNTNAP1P78357 1384 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CLIC1O00299 241 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SNAP29O95721 258 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PAX3P23760 479 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ARL2P36404 184 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PTGER3P43115 390 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CBX5P45973 191 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 DGKZQ13574 1117 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 GARNL3Q5VVW2 1013 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 JAZF1Q86VZ6 243 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 NECTIN3Q9NQS3 549 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PHF24Q9UPV7 400 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PDHXO00330 501 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 EPHX2P34913 555 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SPAM1P38567 509 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 BRCC3P46736 316 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 AMIGO1Q86WK6 493 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 KLHL36Q8N4N3 616 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SUSD6Q92537 303 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 H0YAE9 185 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 DCLK1O15075 740 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 VNN1O95497 513 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PRH1P02810 166 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ACADMP11310 421 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ACADLP28330 430 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 HMGCS1Q01581 520 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CAMK1Q14012 370 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 C4orf46Q504U0 113 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SCML4Q8N228 414 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 MSANTD3Q96H12 275 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 BCAS3Q9H6U6 928 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 FKBPLQ9UIM3 349 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 FBXO10Q9UK96 956 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ANXA2P2A6NMY6 339 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ADM5C9JUS6 153 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 DLGAP1O14490 977 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 BEX3Q00994 111 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CRB2Q5IJ48 1285 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM91A1Q658Y4 838 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 TEX46H3BTG2 121 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 TMIEQ8NEW7 156 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 TCF7L1Q9HCS4 588 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ADAMTS3O15072 1205 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 S100GP29377 79 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 GPD2P43304 727 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 UFM1P61960 85 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 RPA4Q13156 261 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SPERTQ8NA61 448 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 C1orf216Q8TAB5 229 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC9A6Q92581 669 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 FUZQ9BT04 418 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 STARD7Q9NQZ5 370 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 MAB21L2Q9Y586 359 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ALG5Q9Y673 324 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 PDPK1O15530 556 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 CHP2O43745 196 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPB3Q12988 150 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF181Q2M3W8 571 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 TAC4Q86UU9 113 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-202ENST00000369864 GPR25O00155 361 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms