RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ITGB5P18084 799 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EPORP19235 508 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINB6P35237 376 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PGDP52209 483 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TUBA4AP68366 448 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CYP4F2P78329 520 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MC2RQ01718 297 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ENPP2Q13822 863 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KRT71Q3SY84 523 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TEX38Q6PEX7 206 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PODNL1Q6PEZ8 512 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ANO5Q75V66 913 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BEST3Q8N1M1 668 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD44Q8N8A2 993 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ERMNQ8TAM6 284 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BCAS4Q8TDM0 211 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TEKT4Q8WW24 435 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KAT2AQ92830 837 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MCUR1Q96AQ8 359 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CATSPER2Q96P56 530 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC37BQ96QE4 947 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM209Q96SK2 561 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DRC3Q9H069 523 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SIK2Q9H0K1 926 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ABCG8Q9H221 673 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL31Q9H511 634 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MAGIXQ9H6Y5 334 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C7orf69Q9H7B7 122 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SAP30LQ9HAJ7 183 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HAO1Q9UJM8 370 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FBXW11Q9UKB1 542 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GPR132Q9UNW8 380 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZDHHC9Q9Y397 364 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 USP47Q96K76 1375 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PFASO15067 1338 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 WDR27A2RRH5 827 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SPOPO43791 374 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SSX5O60225 188 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF4O60810 478 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRDM1O75626 825 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRKAR1AP10644 381 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FCER1AP12319 257 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MMP9P14780 707 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CKMT2P17540 419 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CA8P35219 290 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MAP2K2P36507 400 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEA11P43364 429 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FASLGP48023 281 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CAPZA1P52907 286 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRKCEQ02156 737 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRKCQQ04759 706 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRCAPQ14761 206 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 METTL11BQ5VVY1 283 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DENND2CQ68D51 928 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CMTM4Q8IZR5 234 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C17orf47Q8NEP4 570 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LPCAT1Q8NF37 534 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IGFBPL1Q8WX77 278 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LPGAT1Q92604 370 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PIGKQ92643 395 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 INPP5DQ92835 1189 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 APBB2Q92870 758 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GRAMD1AQ96CP6 724 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PGBD1Q96JS3 809 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EGLN2Q96KS0 407 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FCRL4Q96PJ5 515 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LMF1Q96S06 567 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PSMB7Q99436 277 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BCL2L14Q9BZR8 327 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NAPBQ9H115 298 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CDT1Q9H211 546 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM245Q9H330 911 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FAM96AQ9H5X1 160 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BARHL2Q9NY43 387 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EURLQ9NYK6 297 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TXNDC16Q9P2K2 825 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MBD2Q9UBB5 411 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 STK17AQ9UEE5 414 aa2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms