RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 CKLFQ9UBR5 152 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PLK4O00444 970 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 STX16O14662 325 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 REM1O75628 298 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 EPOP01588 193 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 GSTT1P30711 240 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 CRISP3P54108 245 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 NFKB2Q00653 900 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 HMGCS1Q01581 520 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 FRG2Q64ET8 278 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SLC9A4Q6AI14 798 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 GIPC3Q8TF64 312 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 FRG2BQ96QU4 278 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 MOCS1Q9NZB8 636 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 GALPQ9UBC7 116 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 A0A0J9YVX5 310 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 FAM234BA2RU67 622 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 LEFTY2O00292 366 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 CHST10O43529 356 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 RGS10O43665 173 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 KDELR3O43731 214 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 CNTN5O94779 1100 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ANGPTL1O95841 491 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 LYNP07948 512 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 CSF2RAP15509 400 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 CLCN7P51798 805 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 DLG1Q12959 904 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PYDC2Q56P42 97 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF311Q5JNZ3 666 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PARP8Q8N3A8 854 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 CBR4Q8N4T8 237 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 KNL1Q8NG31 2342 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 HM13Q8TCT9 377 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PCYT2Q99447 389 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 OXSMQ9NWU1 459 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SIRPGQ9P1W8 387 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 GMEB2Q9UKD1 530 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 C9J4A7 227 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 CXCR6O00574 342 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 NADKO95544 446 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 AHSGP02765 367 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 S100GP29377 79 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 RGS21Q2M5E4 152 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 INAVAQ3KP66 663 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 DENND5AQ6IQ26 1287 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SLC8B1Q6J4K2 584 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 NATD1Q8N6N6 113 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PSMA8Q8TAA3 256 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 RGMAQ96B86 450 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SLC22A14Q9Y267 594 aa10.11□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SHPRHQ149N8 1683 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SAP18O00422 153 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ERI3O43414 337 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ECI2O75521 394 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 TCEA3O75764 348 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 RIPK1Q13546 671 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC66Q68CR7 880 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 OR4C6Q8NH72 309 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 RFKQ969G6 155 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ART5Q96L15 291 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM248Q9NWD8 314 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 SNX7Q9UNH6 387 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PRAMEF11O60813 436 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 FADS2O95864 444 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 KHKP50053 298 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 GATMP50440 423 aa10.1□□□□□ -0.79
ZNF548-202ENST00000366197 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms