RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNT13Q8IUC8 556 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TERB1Q8NA31 727 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TMBIM1Q969X1 311 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 BBS2Q9BXC9 721 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 MOSPD3O75425 235 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM16O95361 564 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ALBP02768 609 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 MESP2Q0VG99 397 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CDKN3Q16667 212 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 KCTD8Q6ZWB6 473 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM46Q7Z4K8 759 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RHBDF1Q96CC6 855 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFYVE19Q96K21 471 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 LATS1O95835 1130 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TRBC1P01850 177 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ALPLP05186 524 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TCF3P15923 654 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ACRV1P26436 265 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 BMPR1AP36894 532 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP3CCP48454 512 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CHRNB3Q05901 458 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TMED1Q13445 227 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 DAG1Q14118 895 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SULT1C3Q6IMI6 304 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZVU0 165 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF4L2Q8NA75 395 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 UBTD2Q8WUN7 234 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB18Q99592 522 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 EGFL8Q99944 293 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 RHBDL2Q9NX52 303 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 OPTCQ9UBM4 332 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC28A1O00337 649 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 FFAR3O14843 346 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR42O15529 346 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ITGALP20701 1170 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 NFKBIAP25963 317 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 PIK3CGP48736 1102 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR107Q5VW38 600 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TMC5Q6UXY8 1006 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB2Q8N680 514 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CHST14Q8NCH0 376 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2T12Q8NG77 320 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 MUS81Q96NY9 551 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TUBA1CQ9BQE3 449 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 NTMT1Q9BV86 223 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 CD84Q9UIB8 345 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC01553A4QN01 128 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PCNAP12004 261 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 AKT1P31749 480 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 HNF1BP35680 557 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 LY6G5CQ5SRR4 150 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MACC1Q6ZN28 852 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZNX1 250 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 HTR3DQ70Z44 454 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM86B1Q8N7N1 296 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 RAD9AQ99638 391 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 IKZF5Q9H5V7 419 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 WWOXQ9NZC7 414 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR47O94967 919 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 BPIP17213 487 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 HMGCS1Q01581 520 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL2L1Q07817 233 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MSRB3Q8IXL7 192 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 UGT2B28Q9BY64 529 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 OBSL1O75147 1896 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 K7EPI3 171 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEB3O15480 346 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ULK1O75385 1050 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 GMNNO75496 209 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 UGT2B4P06133 528 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MTHFRP42898 656 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 GNPDA1P46926 289 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 YAP1P46937 504 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP4F3Q08477 520 aa18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms