RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 TBC1D24Q9ULP9 559 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 PRELID1Q9Y255 219 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 GABRDO14764 452 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 HOXA9P31269 272 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 IFNA8P32881 189 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 SLC15A1P46059 708 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 HK3P52790 923 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 CRISP3P54108 245 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 SLAMF1Q13291 335 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 KEAP1Q14145 624 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 SMU1Q2TAY7 513 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF438Q7Z4V0 828 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 GPR149Q86SP6 731 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 CEP295NLQ96MC4 621 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ATP13A1Q9HD20 1204 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 KIF17Q9P2E2 1029 aa18.5■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 SERPINF2P08697 491 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 IRF3Q14653 427 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 MRNIPQ6NTE8 343 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ELMOD2Q8IZ81 293 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 PGBD5Q8N414 524 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 EGLN2Q96KS0 407 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 PHOX2BQ99453 314 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 TLL1O43897 1013 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 VIPP01282 170 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 MMP2P08253 660 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 HSMCR30P0CW71 290 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 SUOXP51687 545 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 RAD51Q06609 339 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 GALNT3Q14435 633 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 MFSD10Q14728 455 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 TRAF7Q6Q0C0 670 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ATG16L2Q8NAA4 619 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 SIMC1Q8NDZ2 872 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 APH1BQ8WW43 257 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 PYURFQ96I23 114 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 CATSPERZQ9NTU4 200 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 MED16Q9Y2X0 877 aa18.49■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 NUDT6P53370 316 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 HOMEZQ8IX15 550 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 DERL2Q9GZP9 239 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 CLPBQ9H078 707 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 RUBCNLQ9H714 662 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF112Q9UJU3 913 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 GRXCR2A6NFK2 248 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 B3GALT4O96024 378 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 PNPLA4P41247 253 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ABRAXAS2Q15018 415 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA0040Q15053 153 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 KDM4DQ6B0I6 523 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 TM9SF3Q9HD45 589 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 KRT84Q9NSB2 600 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 E2F3O00716 465 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 AKT1P31749 480 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 SLC19A1P41440 591 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 HTR2BP41595 481 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 RPP38P78345 283 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 GPR50Q13585 617 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 CEP19Q96LK0 163 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 NPAP1Q9NZP6 1156 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 PEX16Q9Y5Y5 336 aa18.48■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 CA5AP35218 305 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 LIMS2Q7Z4I7 341 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 P3H2Q8IVL5 708 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB18Q99592 522 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 MMP28Q9H239 520 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 A0A0G2JMP0 313 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 PER2O15055 1255 aa18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PRPF39-201ENST00000355765 DDOSTP39656 456 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms