RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MRNIPQ6NTE8 343 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 TMC5Q6UXY8 1006 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 TMEM150AQ86TG1 271 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 FAM86B1Q8N7N1 296 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 BPIFB1Q8TDL5 484 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 EID2BQ96D98 161 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 VWCEQ96DN2 955 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CDK15Q96Q40 435 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 PSKH2Q96QS6 385 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ILVBLA1L0T0 632 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ANKRD66B4E2M5 251 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 UPK1AO00322 258 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 GSTA4O15217 222 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 RAD51BO15315 384 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 SLC22A3O75751 556 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 RPP40O75818 363 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 GABARAPO95166 117 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MATN4O95460 622 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 FTH1P02794 183 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CKMP06732 381 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CCL5P13501 91 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 FMO3P31513 532 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CDH4P55283 916 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ARPC4P59998 168 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 IFITM2Q01629 132 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 SULT1C3Q6IMI6 304 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 PROSER1Q86XN7 944 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MCFD2Q8NI22 146 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 LRRC3Q9BY71 257 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MAGEH1Q9H213 219 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ASB1Q9Y576 335 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 SUPT3HB4E1H0 165 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 NUAK1O60285 661 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 GUCY1B2O75343 617 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 RFPL2O75678 378 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MFN2O95140 757 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ANGPTL1O95841 491 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 FADS2O95864 444 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CYP4B1P13584 511 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CD1DP15813 335 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ITIH1P19827 911 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MC4RP32245 332 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CSKP41240 450 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MAPKAPK2P49137 400 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 RCAN2Q14206 197 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 LRIT3Q3SXY7 679 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 COLEC12Q5KU26 742 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 L3HYPDHQ96EM0 354 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ACOX2Q99424 681 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 DSN1Q9H410 356 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 NEK6Q9HC98 313 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 COMMD8Q9NX08 183 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 INVSQ9Y283 1065 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 MED16Q9Y2X0 877 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 BTN3A1O00481 513 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 PITPNM1O00562 1244 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 STX7O15400 261 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 TEX28O15482 410 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 KDELR3O43731 214 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 FGF1P05230 155 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 KRT8P05787 483 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ANXA6P08133 673 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 HLA-DPA1P20036 260 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 GABRR2P28476 465 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 GABARAPL2P60520 117 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 RHOAP61586 193 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 VAC14Q08AM6 782 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 CDH18Q13634 790 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 SELPLGQ14242 412 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 UBE2UQ5VVX9 321 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC27-201ENST00000317907 FAM151BQ6UXP7 276 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms