RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 NAGLUP54802 743 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC25A3Q00325 362 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 NFATC2Q13469 925 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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SLC13A3-202ENST00000290317 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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SLC13A3-202ENST00000290317 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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SLC13A3-202ENST00000290317 SERPINI1Q99574 410 aa7.54□□□□□ -1.2
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SLC13A3-202ENST00000290317 PTPRDP23468 1912 aa7.54□□□□□ -1.2
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SLC13A3-202ENST00000290317 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 WASH3PC4AMC7 463 aa7.54□□□□□ -1.2
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SLC13A3-202ENST00000290317 ZBTB14O43829 449 aa7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CDH1P12830 882 aa7.54□□□□□ -1.2
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SLC13A3-202ENST00000290317 BPIP17213 487 aa7.54□□□□□ -1.2
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SLC13A3-202ENST00000290317 CTRB1P17538 263 aa7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CCNA2P20248 432 aa7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CYP2A7P20853 494 aa7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ITGB7P26010 798 aa7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 SPINT3P49223 89 aa7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 COPAP53621 1224 aa7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.54□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.54□□□□□ -1.2
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