RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223129.8

RPA3-201, Transcript of replication protein A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPA3, Length 2,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3-201ENST00000223129 KRT15P19012 456 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 EPHA4P54764 986 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ILKQ13418 452 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 RASA2Q15283 850 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 SBSNQ6UWP8 590 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 OR10G6Q8NH81 332 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 PTERQ96BW5 349 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 PARVBQ9HBI1 364 aa14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 BTN3A3O00478 584 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 DKK1O94907 266 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 MT-ND3P03897 115 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 PYGBP11216 843 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 MPSTP25325 297 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 GLRBP48167 497 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 PPP1CAP62136 330 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 GPLD1P80108 840 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.083e-6■□□□□ 10.7
RPA3-201ENST00000223129 CASP8Q14790 479 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 OR4D1Q15615 310 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.55□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 MYO1CO00159 1063 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 SLC16A5O15375 505 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ZW10O43264 779 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 KLHL2O95198 593 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 GUCA1CO95843 209 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 TFEBP19484 476 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 CYP2A7P20853 494 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 CSF2RBP32927 897 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 KCNC1P48547 511 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ATP6V0D1P61421 351 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 E2F1Q01094 437 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 SP140Q13342 867 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 KRT71Q3SY84 523 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ISCA2Q86U28 154 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ALG9Q9H6U8 611 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 DUX1O43812 170 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 SLC16A8O95907 504 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 PKLRP30613 574 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 SLC26A3P40879 764 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ID4P47928 161 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 RAB28P51157 221 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 SPIDRQ14159 915 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 GPR78Q96P69 363 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.54□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 OR5K3A6NET4 321 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 CPNE6O95741 557 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 HIST1H2ADP20671 130 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 SHMT2P34897 504 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 CAPZBP47756 277 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 GFERP55789 205 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 CLEC14AQ86T13 490 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 OOSP2Q86WS3 158 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ZNF480Q8WV37 535 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 KIAA1191Q96A73 305 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 ARL15Q9NXU5 204 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 KLHL3Q9UH77 587 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 KDM1AO60341 852 aa14.53□□□□□ -0.08
RPA3-201ENST00000223129 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms