RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lama3Q61789 3330 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem236A2ARJ3 344 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr742A2RTP5 311 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ces2hF6Z9B9 558 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ackr2O08707 378 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gnpda1O88958 289 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akt1P31750 480 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MthfsdQ3URQ7 372 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp78Q5U406 512 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bdkrb1Q61125 334 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab3ipQ68EF0 428 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Enpp3Q6DYE8 874 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cys1Q8R4T1 145 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abhd4Q8VD66 342 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Art4Q9CRA0 300 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp13a2Q9CTG6 1169 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam227aQ9D3V8 625 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smok1Q9QYZ4 484 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cst9Q9Z0H6 137 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mgat4eA6H684 439 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930455H04RikD3Z622 58 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r38G3UYA8 861 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r33K7N705 861 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elovl3O35949 271 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gtf2h4O70422 463 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gas2P11862 314 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd19P25918 547 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lman2lP59481 347 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 QrfprP83861 433 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DmwdQ08274 665 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PepdQ11136 493 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LpoQ5SW46 710 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbl1Q64701 1063 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lix1Q6P566 282 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pex11gQ6P6M5 241 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1197Q7TR13 314 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1196Q7TR14 314 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AftphQ80WT5 931 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fastkd3Q8BSN9 661 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kctd2Q8CEZ0 266 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vps50Q8CI71 964 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mcoln3Q8R4F0 553 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptgr1Q91YR9 329 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bbs2Q9CWF6 721 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rcan2Q9JHG2 197 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EefsecQ9JHW4 583 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akr1a1Q9JII6 325 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tp73Q9JJP2 631 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RgrQ9Z2B3 291 aa20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttll2A4Q9E4 540 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lipo4D3Z608 396 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp169E9Q3R6 731 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MlxO08609 298 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MaxP28574 160 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Htr5bP31387 370 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cxcr5Q04683 374 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr149Q3UVY1 732 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taar8aQ5QD07 344 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptpn18Q61152 453 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hs3st2Q673U1 367 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp7Q6A4J8 1103 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dcaf13Q6PAC3 445 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r84Q8R284 318 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cant1Q8VCF1 403 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxl20Q9CZV8 436 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9D1Z2 194 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nufip1Q9QXX8 484 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PrebQ9WUQ2 417 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn8Q9Z260 225 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrgpra2aA0A0R4J1Z0 331 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp964B2RR88 472 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam71f2B2RXB0 297 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pabpc4lG5E8X2 370 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NapsaO09043 419 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Entpd1P55772 510 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klf4Q60793 483 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bfsp2Q6NVD9 416 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf280cQ6P3Y5 742 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wipi2Q80W47 445 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MmaaQ8C7H1 415 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ThtpaQ8JZL3 224 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r185Q8R299 319 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Camk1Q91YS8 374 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MlycdQ99J39 492 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rsl24d1Q99L28 163 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lyrm1Q9CQB7 122 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Themis3Q9CU24 569 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr73Q9CWR1 371 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9CXL3 195 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Neurl2Q9D0S4 285 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc13a2Q9ES88 586 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fads3Q9JJE7 449 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SqorQ9R112 450 aa20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ClockO08785 855 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.3 ms