RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ranbp10Q6VN19 620 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr301Q7TS04 311 aa21.42■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zfp418Q8BFS8 652 aa21.42■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Casp9Q8C3Q9 454 aa21.42■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr47Q8CGF6 920 aa21.42■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q9CR55 154 aa21.42■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc70Q9D9B0 223 aa21.42■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 KelQ9EQF2 713 aa21.42■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zfp964B2RR88 472 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm2237E9Q501 211 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm3591K7N6X2 186 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NagluO88325 739 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Entpd1P55772 510 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arl1P61211 181 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Syndig1lQ3USQ7 237 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtcap2Q5RL79 136 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Klf4Q60793 483 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bhlhb9Q6PB60 539 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cfap206Q6PE87 622 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vtcn1Q7TSP5 283 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tusc3Q8BTV1 347 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abi1Q8CBW3 481 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn1r84Q8R284 318 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtfr2Q8VED8 361 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptov1Q91VU8 416 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Alg13Q9D8C3 1166 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cldn8Q9Z260 225 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sppl2cA2A6C4 690 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kcna10B2RQA1 511 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 9230113P08RikD3YWX3 137 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gnpda1O88958 289 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P01807 119 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DtlQ3TLR7 729 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PtprnQ60673 979 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr813Q7TRH5 310 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 H2-M10.2Q85ZW9 329 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rd3Q8BRE0 195 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kcnc4Q8R1C0 628 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pla2g15Q8VEB4 412 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mta3Q924K8 591 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pramel1Q99MW3 458 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ifitm3Q9CQW9 137 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rnf181Q9CY62 165 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olig2Q9EQW6 323 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adam23Q9R1V7 829 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smok4aA0JLX3 433 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cylc2B1AWN8 422 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r21K7N6Y7 853 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r20L7N2B1 853 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnajb5O89114 348 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf703P0CL69 594 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppm1aP49443 382 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SmoP56726 793 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Isl1P61372 349 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A1bgQ19LI2 512 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dmc1Q61880 340 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prkd1Q62101 918 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dsg4Q7TMD7 1041 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bcas1Q80YN3 633 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rbbp8Q80YR6 893 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pgs1Q8BHF7 553 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr575Q8VH16 318 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sp7Q8VI67 428 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pin4Q9CWW6 131 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kat8Q9D1P2 458 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Thap11Q9JJD0 305 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zbp1Q9QY24 411 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Btnl6A2CG22 539 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pate3B3GLJ3 98 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MndaP0DOV1 425 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccr7P47774 378 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hk3Q3TRM8 922 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 KdsrQ6GV12 332 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Paqr3Q6TCG8 311 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Scn4bQ7M729 228 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppm1nQ8BGL1 404 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ca12Q8CI85 354 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q8K207 121 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr448Q8VES9 310 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Scpep1Q920A5 452 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Col25a1Q99MQ5 666 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dsn1Q9CYC5 348 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fundc2Q9D6K8 151 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sh3glb1Q9JK48 365 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RhoaQ9QUI0 193 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rdh11Q9QYF1 316 aa21.4■■□□□ 1.02
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ifit3bE9PV48 403 aa21.39■■□□□ 1.01
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rhox2hK7N6P1 191 aa21.39■■□□□ 1.01
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Elovl3O35949 271 aa21.39■■□□□ 1.01
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pole2O54956 527 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.4 ms