RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aff4Q9ESC8 1160 aa16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rcan2Q9JHG2 197 aa16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cldn8Q9Z260 225 aa16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm31371A0A1D5RM70 265 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A0A1L1ST33 502 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mllt3A2AM29 569 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp563B8JJZ9 448 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apol11bE9PUZ0 337 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gp1baO35930 734 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grem1O70326 184 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01807 119 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Orm2P07361 207 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nfkb1P25799 971 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp2c37P56654 490 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Isl1P61372 349 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pde7aP70453 456 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ErgP81270 486 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp560Q3URI6 754 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pik3r3Q64143 461 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Paqr3Q6TCG8 311 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Syt14Q7TN84 555 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vtcn1Q7TSP5 283 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prpf18Q8BM39 342 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sp7Q8VI67 428 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sugt1Q9CX34 336 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbkbp1A2A9T0 611 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pgbd1E9Q492 415 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ces2hF6Z9B9 558 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3138K7N754 218 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pfdn6Q03958 127 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cxcr5Q04683 374 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp2c65Q148B1 490 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnks2Q3UES3 1166 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cnih3Q6ZWS4 160 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nim1kQ8BHI9 436 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Man2c1Q91W89 1039 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apbb2Q9DBR4 760 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr703Q9EPF5 319 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cylc2B1AWN8 422 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bard1O70445 765 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ClppO88696 272 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hcn1O88704 910 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nudt2P56380 147 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NficP70255 439 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grin2cQ01098 1239 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pros1Q08761 675 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif2b4Q61749 524 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ifit3Q64345 403 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pwwp2aQ69Z61 730 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lpcat4Q6NVG1 524 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ckmt2Q6P8J7 419 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NcaphQ8C156 731 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abhd4Q8VD66 342 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr846Q8VET8 312 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kat8Q9D1P2 458 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr12Q9JJA4 423 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trip4Q9QXN3 581 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oas1eA0A0J9YV76 386 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdh18E9Q9Q6 790 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01644 108 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01645 108 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01646 108 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01647 108 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp39Q02525 718 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zdhhc11Q14AK4 347 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DtlQ3TLR7 729 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdkl4Q3TZA2 342 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tusc1Q673H1 205 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itln1bQ80ZA0 313 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2-M10.2Q85ZW9 329 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gucy1b2Q8BXH3 824 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bdh2Q8JZV9 245 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif3lQ8QZY1 564 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ugt2b1Q8R084 529 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r84Q8R284 318 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr448Q8VES9 310 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MmadhcQ99LS1 296 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Msh4Q99MT2 958 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9CZV2 255 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp26Q9D700 211 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nmnat1Q9EPA7 285 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FancgQ9EQR6 623 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sh3glb1Q9JK48 365 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pkp3Q9QY23 797 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr54Q9R0D8 334 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp964B2RR88 472 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8267E9Q207 261 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Elovl3O35949 271 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01878 344 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp21P03940 487 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nr5a2P45448 560 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sox2P48432 319 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 InhbbQ04999 411 aa16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp39Q3TIX9 564 aa16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.5 ms