RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 AVL9Q8NBF6 648 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 DTD2Q96FN9 168 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 WDCPQ9H6R7 721 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.37□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 FAM187AA6NFU0 413 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 KDELR3O43731 214 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 LY6G6DO95868 133 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 IGHEP01854 428 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SLC2A4P14672 509 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 OTX2P32243 289 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PPP1CAP62136 330 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 AP1B1Q10567 949 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 GRM3Q14832 879 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ACOX1Q15067 660 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 CNGA3Q16281 694 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 INAQ16352 499 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 C3AR1Q16581 482 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 LIN52Q52LA3 116 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 GALNT13Q8IUC8 556 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 KAT5Q92993 513 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 NT5C3BQ969T7 300 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ITPKCQ96DU7 683 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 CNDP1Q96KN2 507 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 RAB33BQ9H082 229 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 MAGEH1Q9H213 219 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 LIME1Q9H400 295 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 TINAGQ9UJW2 476 aa11.36□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 TLCD2A6NGC4 264 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PSMA7O14818 248 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 AKR1B10O60218 316 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SLC19A2O60779 497 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 DNAJC6O75061 913 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 DCTN3O75935 186 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PDHA1P08559 390 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 MST1P26927 711 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 HADHAP40939 763 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SERPINB4P48594 390 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ABRQ12979 859 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 TMEM126BQ8IUX1 230 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SYTL1Q8IYJ3 562 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 MBD6Q96DN6 1003 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 CPXM1Q96SM3 734 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 KLC2Q9H0B6 622 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 SAR1AQ9NR31 198 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ZNF358Q9NW07 568 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 B4GALT6Q9UBX8 382 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.35□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 DOCK10Q96BY6 2186 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 NUP210LQ5VU65 1888 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 OR5K4A6NMS3 321 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 RNF212BA8MTL3 300 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 PROM1O43490 865 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 BUB1O43683 1085 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 RAMP2O60895 175 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ETV3P41162 512 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 BPIFB4P59827 614 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 HPCAP84074 193 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 CYTH1Q15438 398 aa11.34□□□□□ -0.59
HCG18-241ENST00000602290 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms