RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CPNE9Q8IYJ1 553 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 MINDY1Q8N5J2 469 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB119Q8N690 84 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM14Q96QK8 99 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBB1Q9H4B7 451 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-204ENST00000587718 CD274Q9NZQ7 290 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 GALPQ9UBC7 116 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-204ENST00000587718 ACRV1P26436 265 aa24.91■■□□□ 1.58
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CAPNS1-204ENST00000587718 CBSP35520 551 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF234Q14588 700 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 SMU1Q2TAY7 513 aa24.91■■□□□ 1.58
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CAPNS1-204ENST00000587718 KIF19Q2TAC6 998 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TTLL9Q3SXZ7 439 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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CAPNS1-204ENST00000587718 SRCP12931 536 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ENGP17813 658 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 BNIP2Q12982 314 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DUOXA1Q1HG43 343 aa24.88■■□□□ 1.57
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