RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 DGKEP52429 567 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GRK1Q15835 563 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NTRK3Q16288 839 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CHST9Q7L1S5 443 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CRELD1Q96HD1 420 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SCLYQ96I15 445 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CEP41Q9BYV8 373 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MFFQ9GZY8 342 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LHX5Q9H2C1 402 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRABDQ9H4I3 376 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SARDHQ9UL12 918 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BET1O15155 118 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PLIN3O60664 434 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C22orf31O95567 290 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ITGB5P18084 799 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MATN1P21941 496 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CAPGP40121 348 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CRATP43155 626 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MEOX2P50222 304 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ARSEP51690 589 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC12A3P55017 1021 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HM13Q8TCT9 377 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RORBQ92753 470 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LPPQ93052 612 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SUSD3Q96L08 255 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC115Q96NT0 180 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GABRQQ9UN88 632 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PAPPAQ13219 1627 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GLI3P10071 1580 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ARL5CA6NH57 179 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GSTM1P09488 218 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RARAP10276 462 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GHRHRQ02643 423 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MMRN1Q13201 1228 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD16Q32M84 506 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CENPPQ6IPU0 288 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM228AQ86W67 206 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM131BQ86XD5 332 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CACUL1Q86Y37 369 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MUL1Q969V5 352 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GLTPQ9NZD2 209 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TIMM22Q9Y584 194 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SPEF2Q9C093 1822 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MYOM1P52179 1685 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf60A6NFR6 353 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADH1BP00325 375 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CD6P30203 668 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDH4P55283 916 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 POU4F2Q12837 409 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDH17Q12864 832 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TAF5Q15542 800 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZBED5Q49AG3 693 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAXCQ5TGI0 409 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SERINC5Q86VE9 423 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OSTM1Q86WC4 334 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CD101Q93033 1021 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SNX18Q96RF0 628 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms