RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF398	Q8TD17	642 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	COG1	Q8WTW3	980 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	C14orf79	Q96F83	325 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	RNF157	Q96PX1	679 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NDC1	Q9BTX1	674 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SMOX	Q9NWM0	555 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CTSF	Q9UBX1	484 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf74	A8MZ97	194 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MED26	O95402	600 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CYP1A2	P05177	515 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TPM2	P07951	284 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CELA2A	P08217	269 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MSH3	P20585	1137 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ALAS2	P22557	587 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	AKT1	P31749	480 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SOX11	P35716	441 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	WNT3A	P56704	352 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SLC14A2	Q15849	920 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	XKRX	Q6PP77	449 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CD63	P08962	238 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	KDELR1	P24390	212 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	MCM3	P25205	808 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PTPN3	P26045	913 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	XIAP	P98170	497 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PMP22	Q01453	160 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	PDK2	Q15119	407 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-222	ENST00000533557	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	OR1D4	P47884	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	PRLHR	P49683	370 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	ARG2	P78540	354 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	WASHC5	Q12768	1159 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	CEP97	Q8IW35	865 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	HM13	Q8TCT9	377 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	NRGN	Q92686	78 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	HAS2	Q92819	552 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	TEKT5	Q96M29	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-222	ENST00000533557	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55

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