RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511725.5

UBE2D2-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 D2, human

TSL 2 BASIC

Gene UBE2D2, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2D2-208	ENST00000511725	RPA4	Q13156	261 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	GBX1	Q14549	363 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	KYNU	Q16719	465 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	AMZ1	Q400G9	498 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	HES3	Q5TGS1	186 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CYS1	Q717R9	158 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CALML6	Q8TD86	181 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	C12orf66	Q96MD2	445 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	ABCG4	Q9H172	646 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	OGFR	Q9NZT2	677 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	KLK13	Q9UKR3	277 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	ITPR1	Q14643	2758 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	VIP	P01282	170 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	FAM153B	P0C7A2	387 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CDK4	P11802	303 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	SLC2A4	P14672	509 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	HAL	P42357	657 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CD151	P48509	253 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CDKN2D	P55273	166 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	MGAT5	Q09328	741 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	ABR	Q12979	859 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79	4e-6	■■■■□ 21
UBE2D2-208	ENST00000511725	SQSTM1	Q13501	440 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	GPR18	Q14330	331 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	FAM153C	Q494X1	144 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	SLC38A3	Q99624	504 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	UCK1	Q9HA47	277 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	RDH14	Q9HBH5	336 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	PCM1	Q15154	2024 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	FAM159B	A6NKW6	160 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	PFDN6	O15212	129 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	MYBL2	P10244	700 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	JUP	P14923	745 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TYRP1	P17643	537 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CHRM3	P20309	590 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CSF2RB	P32927	897 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	PRKG2	Q13237	762 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CUL1	Q13616	776 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	GALNT7	Q86SF2	657 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	PDZD3	Q86UT5	571 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	IFT20	Q8IY31	132 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	TMEM159	Q96B96	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	FMO2	Q99518	471 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	NDN	Q99608	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UBE2D2-208	ENST00000511725	GPR21	Q99679	349 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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