RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498520.1

NDUFS1-210, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS1, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-210ENST00000498520 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.51□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.51□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.51□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.51□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 A0A1B0GTL3 188 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 F5H423 210 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 TIMM44O43615 452 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 UGT1A9O60656 530 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 GLRA3O75311 464 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 IL18BPO95998 194 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ITGA2BP08514 1039 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 HLA-EP13747 358 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CFPP27918 469 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 TYK2P29597 1187 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 HOXD12P35452 270 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 RASSF2P50749 326 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 TPMTP51580 245 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 RENBPP51606 427 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CLDN6P56747 220 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CRADDP78560 199 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 TMPRSS15P98073 1019 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 EFEMP1Q12805 493 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 MPP3Q13368 585 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 BMPR2Q13873 1038 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 LAYNQ6UX15 382 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 C14orf80Q86SX3 495 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 FITM2Q8N6M3 262 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CNTD1Q8N815 330 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ZNF366Q8N895 744 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CEP76Q8TAP6 659 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 C16orf92Q96LL3 132 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 C7orf26Q96N11 449 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 RBBP8Q99708 897 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 GPR174Q9BXC1 333 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 MTG2Q9H4K7 406 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 EBF2Q9HAK2 575 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 DLL4Q9NR61 685 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CROTQ9UKG9 612 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 NEU3Q9UQ49 428 aa6.5□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 A0A1B0GVT2 93 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 FAM149AA5PLN7 773 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 USP12O75317 370 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 RASSF9O75901 435 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 IGLV3-27P01718 113 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 BPGMP07738 259 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 HMBSP08397 361 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ERVK-10P10266 1014 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 BGNP21810 368 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CD6P30203 668 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ACSL1P33121 698 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ADRA1AP35348 466 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ARFIP2P53365 341 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 LIMK2P53671 638 aa6.49□□□□□ -1.37
NDUFS1-210ENST00000498520 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms