RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 OR6B1O95007 311 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN12O95859 305 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LBPP18428 481 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CAPN3P20807 821 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GPX3P22352 226 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 OXTRP30559 389 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RXRGP48443 463 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V0D1P61421 351 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NFKB2Q00653 900 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CREB5Q02930 508 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 IER5LQ5T953 404 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CIPCQ9C0C6 399 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CEP44Q9C0F1 390 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PIF1Q9H611 641 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZNF225Q9UK10 706 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MYO9BQ13459 2157 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SYCE1LA8MT33 242 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ANGPT2O15123 496 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TPST1O60507 370 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CD70P32970 193 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GDF5P43026 501 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PCYT1AP49585 367 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 XIAPP98170 497 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FOLH1Q04609 750 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 BCL2L1Q07817 233 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NRF1Q16656 503 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SATL1Q86VE3 508 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MIER2Q8N344 545 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FAM110BQ8TC76 370 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TEX37Q96LM6 180 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CLPBQ9H078 707 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZNF839A8K0R7 811 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PGLSO95336 258 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PGM3O95394 542 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 STAMBPO95630 424 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 UQCRBP14927 111 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CCR5P51681 352 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LMAN2Q12907 356 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TGFBIQ15582 683 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FUT11Q495W5 492 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 KANK2Q63ZY3 851 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RETSATQ6NUM9 610 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SCAIQ8N9R8 606 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GIPC3Q8TF64 312 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MAP10Q9P2G4 905 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PCTPQ9UKL6 214 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TAF4O00268 1085 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FGF4P08620 206 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HNF1BP35680 557 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GRIA3P42263 894 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PTGER3P43115 390 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HTR6P50406 440 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GK3PQ14409 553 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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