RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CDH20Q9HBT6 801 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf60A6NFR6 353 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 DNM1LO00429 736 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 WDPCPO95876 746 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 INHBAP08476 426 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 MYL6BP14649 208 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00205P59089 165 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SYT14P1Q58G82 188 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT13Q86X67 352 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SNX32Q86XE0 403 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL7Q8IXQ5 586 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf19Q8IY42 314 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ATAD1Q8NBU5 361 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 DUX5Q96PT3 197 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ZPBPQ9BS86 351 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CDH7Q9ULB5 785 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0U1RQK1 487 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF320A2RRD8 509 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 OOEPA6NGQ2 149 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LACTBL1A8MY62 500 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SYNGR3O43761 229 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ACSL3O95573 720 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ALPLP05186 524 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CSN3P07498 182 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 GNAZP19086 355 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SOAT1P35610 550 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B3P37058 310 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 DLK1P80370 383 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SLMAPQ14BN4 828 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 MEP1BQ16820 701 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CDO1Q16878 200 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TUBA1AQ71U36 451 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP206Q8IYR0 622 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 OCC1Q8TAD7 63 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 MED30Q96HR3 178 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 Q9N2K0 584 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LIPT1Q9Y234 373 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PRB8 838 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ACP2P11117 423 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 HTR6P50406 440 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 PDLIM4P50479 330 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 PDX1P52945 283 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ART1P52961 327 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CX3CL1P78423 397 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 IYDQ6PHW0 289 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 NSMAFQ92636 917 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 DNASE1L2Q92874 299 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 LYZL4Q96KX0 146 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 CD93Q9NPY3 652 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 GKN1Q9NS71 199 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PS18 150 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 BAG2O95816 211 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 EPCAMP16422 314 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA7Q13683 1181 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.22□□□□□ -1.25
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