RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 ULK4Q96C45 1275 aa20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 AGAP4Q96P64 663 aa20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 COPS8Q99627 209 aa20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 HGH1Q9BTY7 390 aa20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 FBXL4Q9UKA2 621 aa20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 PKDREJQ9NTG1 2253 aa20.09■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 HEATR9A2RTY3 570 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 C5orf60A6NFR6 353 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 AGAP14A8MT82 685 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 HCRTR1O43613 425 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 AGTP01019 485 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 STSP08842 583 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 TMEM253P0C7T8 217 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 UGT2B7P16662 529 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 GRNP28799 593 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 ARHGAP25P42331 645 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 GABRA4P48169 554 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 ZIC1Q15915 447 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 SLC18A3Q16572 532 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 IGFL2Q6UWQ7 119 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 NXPE1Q8N323 547 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 CNDP1Q96KN2 507 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 NDC1Q9BTX1 674 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 SLC6A20Q9NP91 592 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 COPG2Q9UBF2 871 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.08■□□□□ 0.81
NELFE-210ENST00000491139 PDZD2O15018 2839 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 CST8O60676 142 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 TNNT1P13805 278 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 MMP11P24347 488 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 PDHA2P29803 388 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 XIAPP98170 497 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 RPA4Q13156 261 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 TLR1Q15399 786 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 FJX1Q86VR8 437 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 TMEM151BQ8IW70 566 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 FICDQ9BVA6 458 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ICKQ9UPZ9 632 aa20.07■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ITGALP20701 1170 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 SHMT2P34897 504 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 CDKN2BP42772 138 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 FANCCQ00597 558 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 KAZNQ674X7 775 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 P3H4Q92791 437 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 OR2A14Q96R47 310 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 CDC23Q9UJX2 597 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.06■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ALOX12BO75342 701 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 GYPCP04921 128 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 CTSBP07858 339 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ALAS2P22557 587 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 GEMP55040 296 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 UBASH3AP57075 661 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 FCRL6Q6DN72 434 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 SNX20Q7Z614 316 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 SLX1AQ9BQ83 275 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 TSPY26PQ9H489 355 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 OLAHQ9NV23 265 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.05■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 A0A0J9YY10 115 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ANXA9O76027 345 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 CRTAMO95727 393 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 TAZQ16635 292 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 RANBP10Q6VN20 620 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 DNAJC22Q8N4W6 341 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 BCORP1Q8N888 145 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 DLG3Q92796 817 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 LHPPQ9H008 270 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.04■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa20.03■□□□□ 0.8
NELFE-210ENST00000491139 JRKO75564 520 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms