RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 E7EVH7 732 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 OR56A5P0C7T3 313 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 UGT2B7P16662 529 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CCR7P32248 378 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 SHMT2P34897 504 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 NLRP9Q7RTR0 991 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM73Q86UV7 250 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC89Q8N998 374 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CPT1BQ92523 772 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 MENTQ9BUN1 341 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 FANCEQ9HB96 536 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CHRAC1Q9NRG0 131 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TREX1Q9NSU2 369 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TLK1Q9UKI8 766 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 GPC4O75487 556 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJB5O75953 348 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 GAS8O95995 478 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 TCTN3Q6NUS6 607 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 FAM198BQ6UWH4 519 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A15Q8IZD6 547 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 OR6P1Q8NGX9 317 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 AP1M1Q9BXS5 423 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 LZTFL1Q9NQ48 299 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB3-211ENST00000490677 NUP210LQ5VU65 1888 aa26.89■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PCM1Q15154 2024 aa26.89■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 RFPL1O75677 317 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PDGFAP04085 211 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 RAB40ALP0C0E4 278 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 RPS15P62841 145 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CRADDP78560 199 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CCZ1BP86790 482 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 FAM69BQ5VUD6 431 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CARD6Q9BX69 1037 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 OR6C2Q9NZP2 312 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 POLG2Q9UHN1 485 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PLAGL1Q9UM63 463 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 HECTD1Q9ULT8 2610 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 IQCF5A8MTL0 148 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 GRB7Q14451 532 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PCID2Q5JVF3 399 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CPZQ66K79 652 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 SEC14L1Q92503 715 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 MKRN2OSH3BPM6 223 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 FGGP02679 453 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CTSBP07858 339 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC175P0C221 793 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 ARNTP27540 789 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 KCNJ1P48048 391 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 ITGA1P56199 1179 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PRAMEP78395 509 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 SYTL3Q4VX76 610 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 COLEC12Q5KU26 742 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC8AQ8IWT6 810 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 SYTL1Q8IYJ3 562 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 THAP4Q8WY91 577 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CLIP3Q96DZ5 547 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 NLNQ9BYT8 704 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 P2RY12Q9H244 342 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CATSPERZQ9NTU4 200 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF749O43361 778 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CYP2A7P20853 494 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 AOAHP28039 575 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 NMBRP28336 390 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PTCHD3Q3KNS1 767 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 LINC01555Q8NAE3 123 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 TTC1Q99614 292 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 SERTAD3Q9UJW9 196 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 TCFL5Q9UL49 500 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 SLCO2B1O94956 709 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PKLRP30613 574 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 HSPA14Q0VDF9 509 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 KYNUQ16719 465 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 KRT222Q8N1A0 295 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 TCTN2Q96GX1 697 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 MLXIPLQ9NP71 852 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0J9YY10 115 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms