RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	SPATA13	Q96N96	652 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	BTRC	Q9Y297	605 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PCM1	Q15154	2024 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	OR6C74	A6NCV1	312 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PEX12	O00623	359 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	STS	P08842	583 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PIRT	P0C851	137 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PAFAH1B1	P43034	410 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	KCNJ1	P48048	391 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	DCDC1	P59894	354 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ART3	Q13508	389 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GALNT3	Q14435	633 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SLC14A2	Q15849	920 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	HIF1A	Q16665	826 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GBA3	Q9H227	469 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	UBP1	Q9NZI7	540 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26	5e-6	■□□□□ 10.2
RBM3-208	ENST00000489344	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PMPCB	O75439	489 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	IFNB1	P01574	187 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	COX6B1	P14854	86 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	MPP3	Q13368	585 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PRPSAP1	Q14558	356 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SSPN	Q14714	243 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PCSK7	Q16549	785 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PARP6	Q2NL67	630 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	P3H1	Q32P28	736 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GDAP1	Q8TB36	358 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	FAR1	Q8WVX9	515 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	POM121	Q96HA1	1249 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	RAD18	Q9NS91	495 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PHF2	O75151	1096 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	ANXA9	O76027	345 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	IGHE	P01854	428 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	ETS1	P14921	441 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	AGXT	P21549	392 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	CDH3	P22223	829 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	PSMB4	P28070	264 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	HADHA	P40939	763 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	GEM	P55040	296 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	CDC16	Q13042	620 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	KDELC1	Q6UW63	502 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	CARF	Q8N187	725 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM3-208	ENST00000489344	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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