RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488629.5

GIGYF2-240, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 4

Gene GIGYF2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-240	ENST00000488629	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIGYF2-240	ENST00000488629		A0A0U1RQK1	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	WDPCP	O95876	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	DAO	P14920	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF23	P17027	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	PSMA3	P25788	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CCKBR	P32239	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	HSPA1L	P34931	641 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	HTR6	P50406	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	NAGLU	P54802	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	UBASH3A	P57075	661 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	FN3K	Q9H479	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	DNM1L	O00429	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	STX6	O43752	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CSN3	P07498	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	NGFR	P08138	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	GNAZ	P19086	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	DSCR9	P59020	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	NSMAF	Q92636	917 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	PDE9A	O76083	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	ALPL	P05186	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	FUT6	P51993	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	THOP1	P52888	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CX3CL1	P78423	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	MFAP5	Q13361	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	CUL3	Q13618	768 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	UGCG	Q16739	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	MEP1B	Q16820	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIGYF2-240	ENST00000488629	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms