RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX7Q9UNH6 387 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-207ENST00000484547 TACC2O95359 2948 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-207ENST00000484547 TLCD2A6NGC4 264 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 AURKAO14965 403 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CLGNO14967 610 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX3O60493 162 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CEACAM4O75871 244 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM63AO94886 807 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CHN1P15882 459 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 LPOP22079 712 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CCND1P24385 295 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC18A1P54219 525 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 HSD11B2P80365 405 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PDK2Q15119 407 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 RPE65Q16518 533 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 LCN10Q6JVE6 187 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 KMT5CQ86Y97 462 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 D2HGDHQ8N465 521 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 C19orf60Q96EN9 201 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 TCTN2Q96GX1 697 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 TTC25Q96NG3 672 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 WHRNQ9P202 907 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 FBN2P35556 2912 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 OR5K3A6NET4 321 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP5HO75947 161 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP1A2P05177 515 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ITGA1P56199 1179 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 TAS2R40P59535 323 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CDK18Q07002 472 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 RAPSNQ13702 412 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 NR6A1Q15406 480 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 AMZ2Q86W34 360 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 GPATCH11Q8N954 259 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB9Q96C00 473 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 FAF2Q96CS3 445 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 AGAP3Q96P47 875 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 VPS35Q96QK1 796 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CD180Q99467 661 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 HEY1Q9Y5J3 304 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PCSK5Q92824 1860 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 F8P00451 2351 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 DOCK10Q96BY6 2186 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 POP7O75817 140 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 SUN1O94901 812 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 LDLRP01130 860 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CTSCP53634 463 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 AP1B1Q10567 949 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 NFE2L1Q14494 772 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 TMTC4Q5T4D3 741 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PPM1MQ96MI6 270 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CENPHQ9H3R5 247 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PPCSQ9HAB8 311 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 GPR83Q9NYM4 423 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 TCFL5Q9UL49 500 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 OR6C74A6NCV1 312 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 OR2AG2A6NM03 316 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 MEN1O00255 615 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 RASGRF2O14827 1237 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 GPR39O43194 453 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 RIPK2O43353 540 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 PMPCBO75439 489 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-207ENST00000484547 NDST3O95803 873 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms