RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 NCSTNQ92542 709 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB9Q96C00 473 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 VPS11Q9H270 941 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 LRRN3Q9H3W5 708 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 RDH14Q9HBH5 336 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 POLG2Q9UHN1 485 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TLK1Q9UKI8 766 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 A0A096LPK6 155 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 OR6C74A6NCV1 312 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 GFYI3L273 518 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CDC7O00311 574 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RASGRF2O14827 1237 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 DUX1O43812 170 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB14O43829 449 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 C2P06681 752 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 C8GP07360 202 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 MPSTP25325 297 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 EPHA4P54764 986 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 GPLD1P80108 840 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 E2F1Q01094 437 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SPIDRQ14159 915 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CSHL1Q14406 222 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 GRB7Q14451 532 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RSC1A1Q92681 617 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 DLG3Q92796 817 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 MTBPQ96DY7 904 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 IL17FQ96PD4 163 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 DERL2Q9GZP9 239 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PPCSQ9HAB8 311 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 OGFRQ9NZT2 677 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KLHL3Q9UH77 587 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ICKQ9UPZ9 632 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ACOT9Q9Y305 439 aa8.58□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 A0A087X1B8 175 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 GSAPA4D1B5 854 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 D6RAR5 112 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 GOLGA8RI6L899 631 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 MYO1CO00159 1063 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SLC16A5O15375 505 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KDM1AO60341 852 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CDH16O75309 829 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RFPL1O75677 317 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TCEA3O75764 348 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 DKK1O94907 266 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CPNE6O95741 557 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 MPOP05164 745 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CDK4P11802 303 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CD1DP15813 335 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KRT15P19012 456 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CYP2A7P20853 494 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PKLRP30613 574 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CSF2RBP32927 897 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SHMT2P34897 504 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 MAGEA12P43365 314 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CAPZBP47756 277 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 GLRBP48167 497 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CSRP3P50461 194 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RAB28P51157 221 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 GFERP55789 205 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1CAP62136 330 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CFHR1Q03591 330 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 DLG1Q12959 904 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SP140Q13342 867 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PHKG1Q16816 387 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 HES3Q5TGS1 186 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 IRGCQ6NXR0 463 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KLHL35Q6PF15 583 aa8.57□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms