RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465120.3

HOXB3-204, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB3, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF185O15231 689 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 LIASO43766 372 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OR1I1O60431 355 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OR2B3O76000 313 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TMEM63AO94886 807 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 UGT2B7P16662 529 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ADRA1DP25100 572 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RORAP35398 523 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PRAMEP78395 509 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 MLIPQ5VWP3 458 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PACS1Q6VY07 963 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CCDC89Q8N998 374 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OR4L1Q8NH43 312 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TCTN2Q96GX1 697 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 NBASA2RRP1 2371 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 COL12A1Q99715 3063 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 VPS4BO75351 444 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 MSL3P1P0C860 447 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ETS1P14921 441 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ACADLP28330 430 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OTX2P32243 289 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 GRIA1P42261 906 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 C1orf189Q5VU69 101 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 MIB2Q96AX9 1013 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OR2A14Q96R47 310 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 FAM60AQ9NP50 221 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 VPS4AQ9UN37 437 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 FLNCQ14315 2725 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 A0A0J9YY10 115 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 KRT86O43790 486 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SUN1O94901 812 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 APRTP07741 180 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PSMA3P25788 255 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RRADP55042 308 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 NCF4Q15080 339 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 NADK2Q4G0N4 442 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RAB43Q86YS6 212 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SGSM3Q96HU1 749 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF778Q96MU6 729 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RANBP9Q96S59 729 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CAPN1P07384 714 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CBSLP0DN79 551 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CDC25BP30305 580 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CCR7P32248 378 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CBSP35520 551 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ATP1A4Q13733 1029 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 RPS6KA1Q15418 735 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ZIC1Q15915 447 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 KYNUQ16719 465 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 MED25Q71SY5 747 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ZBTB2Q8N680 514 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB3-204ENST00000465120 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms