RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 TEX26Q8N6G2 289 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 C17orf50Q8WW18 174 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 TSC22D3Q99576 134 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 RTKNQ9BST9 563 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 LGR4Q9BXB1 951 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ANKHQ9HCJ1 492 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 STK16O75716 305 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 CTSLP07711 333 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ACRV1P26436 265 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 RFX3P48380 749 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 NXPH1P58417 271 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 RPA4Q13156 261 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 MUM1Q2TAK8 710 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 MANEAQ5SRI9 462 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 METTL6Q8TCB7 284 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 POT1Q9NUX5 634 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFB5O43674 189 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 EPN2O95208 641 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 SLC34A2O95436 690 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 HBQ1P09105 142 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 HOXA6P31267 233 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 SSR2P43308 183 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 SEC24CP53992 1094 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 GAS6Q14393 721 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 MMEL1Q495T6 779 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ART4Q93070 314 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 NXPE2Q96DL1 559 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF570Q96NI8 536 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 EXO5Q9H790 373 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM202A6NGA9 273 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 K7ESM1 405 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 C1SP09871 688 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 METAP1P53582 386 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 STX4Q12846 297 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ALG11Q2TAA5 492 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ACSM2BQ68CK6 577 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 TTC27Q6P3X3 843 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 KDELC1Q6UW63 502 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 PAGE2Q7Z2X7 111 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 TEX9Q8N6V9 391 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ASB12Q8WXK4 309 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 APOLD1Q96LR9 279 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC138Q96M89 665 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 PWWP2AQ96N64 755 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM14Q96QK8 99 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 GJB3O75712 270 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 GNAZP19086 355 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 CCND1P24385 295 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 AP1S2P56377 157 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 FBXW4P57775 412 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 TP53BP2Q13625 1128 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ACAD11Q709F0 780 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 PGBD5Q8N414 524 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 DLG3Q92796 817 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 TAC3Q9UHF0 121 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 MT-CO3P00414 261 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 HPGDP15428 266 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 DRD3P35462 400 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 SLC1A2P43004 574 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 GPLD1P80108 840 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 MC1RQ01726 317 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJC3Q13217 504 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-215ENST00000462256 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms