RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 OXR1Q8N573 874 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 PKP4Q99569 1192 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 RDH14Q9HBH5 336 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 KLF15Q9UIH9 416 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 TIMM22Q9Y584 194 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 AXIN1O15169 862 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 KATNA1O75449 491 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 C1orf105O95561 183 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ANXA5P08758 320 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 HIST1H2ADP20671 130 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ITPKAP23677 461 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SNCBQ16143 134 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 RBBP7Q16576 425 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SYVN1Q86TM6 617 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 HID1Q8IV36 788 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR92Q96MX6 357 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 MCM8Q9UJA3 840 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 DIAPH2O60879 1101 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 EML2O95834 649 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC16A8O95907 504 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP2A7P20853 494 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 EDAQ92838 391 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 CD244Q9BZW8 370 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 HEY2Q9UBP5 337 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ASF1AQ9Y294 204 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 PCM1Q15154 2024 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 MATN2O00339 956 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 IDH3AP50213 366 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA1024LP59773 190 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 GTF2H2Q13888 395 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.856e-7■■■■□ 20.2
SH3BP2-204ENST00000452765 ALG11Q2TAA5 492 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 FITM2Q8N6M3 262 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 IL17FQ96PD4 163 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 OR7A17O14581 309 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 RASGRP1O95267 797 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 THEGLP0DJG4 465 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 EPHA3P29320 983 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 CLCA4Q14CN2 919 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 AGAP11Q8TF27 550 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 FOPNLQ96NB1 174 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 OR52B2Q96RD2 323 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 LRP4O75096 1905 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 METTL12A8MUP2 240 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 OR4F21O95013 312 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 WNT1P04628 370 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 HTR1BP28222 390 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 CTBSQ01459 385 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 LCP2Q13094 533 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 DPEP2Q9H4A9 486 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 IPPKQ9H8X2 491 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-204ENST00000452765 KLQ9UEF7 1012 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms