RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 OPA1O60313 960 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RPN2P04844 631 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 JUPP14923 745 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ALDH4A1P30038 563 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 LIMK2P53671 638 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 EPHA4P54764 986 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 POU4F1Q01851 419 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ABRQ12979 859 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.763e-6■■■□□ 15.8
RABGEF1-205ENST00000450873 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 EMBQ6PCB8 327 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRED1Q7Z699 444 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TBC1D21Q8IYX1 336 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CD200R1Q8TD46 325 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 FOPNLQ96NB1 174 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC30A3Q99726 388 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3GL2Q99962 352 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRN3Q9H3W5 708 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 POLG2Q9UHN1 485 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 IKBKGQ9Y6K9 419 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 B4GAT1O43505 415 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MPC1LP0DKB6 136 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MAPK9P45984 424 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RGS4P49798 205 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC12A2P55011 1212 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 OR1D5P58170 312 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CCL7P80098 99 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GPLD1P80108 840 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PHC3Q8NDX5 983 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10G6Q8NH81 332 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 BCAS4Q8TDM0 211 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TSPAN17Q96FV3 270 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR22Q99680 433 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 KDM1AO60341 852 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SAT1P21673 171 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MSH2P43246 934 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SQSTM1Q13501 440 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR18Q14330 331 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC29A2Q14542 456 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 HES3Q5TGS1 186 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PAQR3Q6TCH7 311 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ACVR1CQ8NER5 493 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5K2Q8NHB8 316 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC44A1Q8WWI5 657 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 OLFM1Q99784 485 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC77Q9BR77 488 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 POPDC3Q9HBV1 291 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC24A2Q9UI40 661 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC39A10Q9ULF5 831 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM155BO75949 473 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MATN4O95460 622 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 INHBAP08476 426 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ITGA2BP08514 1039 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 NEFHP12036 1026 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNFP41002 786 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPINB9P50453 376 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R39P59534 338 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 IL2P60568 153 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 USP10Q14694 798 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 RTP5Q14D33 572 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TTC23LQ6PF05 361 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL35Q6PF15 583 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 TAOK1Q7L7X3 1001 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 PIM3Q86V86 326 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CPNE9Q8IYJ1 553 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP61Q8NHU2 1237 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGEC3Q8TD91 643 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 CAVIN3Q969G5 261 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-205ENST00000450873 DPYSL5Q9BPU6 564 aa10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.2 ms