RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 MANBAO00462 879 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC6A2P23975 617 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PRLHRP49683 370 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 UFM1P61960 85 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CREB5Q02930 508 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 TMC5Q6UXY8 1006 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 NLRP8Q86W28 1048 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ELMO1Q92556 727 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 FBXL8Q96CD0 374 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 DTD2Q96FN9 168 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP1R16AQ96I34 528 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD12Q6UB98 2062 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 AQP12BA6NM10 295 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 NME4O00746 187 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD28O15084 1053 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAJA2O60884 412 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PRPH2P23942 346 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PEX2P28328 305 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CCR3P51677 355 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 NFYCQ13952 458 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP20A1Q6UW02 462 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 DET1Q7L5Y6 550 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 DHFR2Q86XF0 187 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 AQP12AQ8IXF9 295 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM9CQ8IZT9 166 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 L3MBTL4Q8NA19 623 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 EFHD1Q9BUP0 239 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 C1orf50Q9BV19 199 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC730098B7Z3J9 87 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ATG13O75143 517 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC7A1P30825 629 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 GDF5P43026 501 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 GNPDA1P46926 289 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 C9orf64Q5T6V5 341 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 FGF13Q92913 245 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 AP2M1Q96CW1 435 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 COL4A3Q01955 1670 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ASPDHA6ND91 283 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 HEPACAM2A8MVW5 462 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 PRRT4C9JH25 899 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 UGDHO60701 494 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ACPPP15309 386 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ACOX1Q15067 660 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 IL23RQ5VWK5 629 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 LCN8Q6JVE9 175 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 UCMAQ8WVF2 138 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ATL1Q8WXF7 558 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 NXPE3Q969Y0 559 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 TEX37Q96LM6 180 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 MTG2Q9H4K7 406 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 KLQ9UEF7 1012 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 SNX6Q9UNH7 406 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 EPORP19235 508 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 BCL7AQ4VC05 210 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 LPCAT4Q643R3 524 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 TICAM1Q8IUC6 712 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 VRK3Q8IV63 474 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2T34Q8NGX1 318 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2T3Q8NH03 318 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM125Q96AQ2 219 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB18Q99592 522 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CCM2Q9BSQ5 444 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM245Q9H330 911 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 EBF3Q9H4W6 596 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ACTR8Q9H981 624 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAJC11Q9NVH1 559 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CMTM6Q9NX76 183 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ACTR3BQ9P1U1 418 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 AP4S1Q9Y587 144 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 AREL1O15033 823 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 IL12AP29459 219 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDH1Q08174 1060 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-202ENST00000435136 CACHD1Q5VU97 1274 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms