RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCG4Q9H172 646 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 LAMB1P07942 1786 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1G1O75348 118 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GLUD2P49448 558 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MTPNP58546 118 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF234Q14588 700 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SNAP47Q5SQN1 464 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCD3Q6STE5 483 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINA9Q86WD7 417 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MCEMP1Q8IX19 187 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MALT1Q9UDY8 824 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FETUBQ9UGM5 382 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL21EPA6NDL7 271 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC22A2O15244 555 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAMEF12O95522 483 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GOT2P00505 430 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PDHA2P29803 388 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GRK6P43250 576 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ARPC4P59998 168 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MC1RQ01726 317 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MERTKQ12866 999 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.81□□□□□ -0.682e-7■■■□□ 18
EFTUD2-202ENST00000426333 DAG1Q14118 895 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR23BQ6ZRT6 265 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2L5Q8NG80 312 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR5K1Q8NHB7 308 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CRELD1Q96HD1 420 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MED11Q9P086 117 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C2CD4BA6NLJ0 364 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TULP2O00295 520 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN4O14817 238 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 INSIG1O15503 277 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PI15O43692 258 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1F1O43749 312 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TBX10O75333 385 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GATBO75879 557 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C8BP07358 591 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CD36P16671 472 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CMPK1P30085 196 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CRY2Q49AN0 593 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJB8Q8NHS0 232 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 AZIN2Q96A70 460 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF347Q96SE7 839 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GAL3ST1Q99999 423 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MGME1Q9BQP7 344 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 EBPLQ9BY08 206 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBPLQ9UIM3 349 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SNED1Q8TER0 1413 aa10.81□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0G2JPF8 293 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PITPNM1O00562 1244 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 LINGO3P0C6S8 592 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ITIH1P19827 911 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PTGIRP43119 386 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 HADHBP55084 474 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CBLBQ13191 982 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SYT16Q17RD7 645 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM192Q8IY95 271 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PPTC7Q8NI37 304 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDH19Q8TAB3 1148 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL21AQ8WXB1 218 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 COL1A2P08123 1366 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC22A1O15245 554 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 POP4O95707 220 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CYB5AP00167 134 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 RLN2P04090 185 aa10.8□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTT2BP0CG30 244 aa10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms