RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACSM2BQ68CK6 577 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD54Q6NXT1 300 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSANTD2Q6P1R3 559 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLC3Q6P597 504 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF600Q6ZNG1 722 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM26Q6ZUK4 368 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL17RELQ6ZVW7 336 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 FCRLAQ7L513 359 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF683Q8IZ20 524 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIRREL3Q8IZU9 778 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC22Q8N4W6 341 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACVR1CQ8NER5 493 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10G7Q8NGN6 311 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ROBO4Q8WZ75 1007 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNAPC3Q92966 411 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM159Q96B96 161 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSNARE1Q96NA8 513 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 GUCD1Q96NT3 240 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCL2L13Q9BXK5 485 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 HDHD5Q9BXW7 423 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM106BQ9NUM4 274 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLRF1Q9NZS2 232 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 UPB1Q9UBR1 384 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC23Q9UJX2 597 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGA2Q9UJY4 613 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 PADI3Q9ULW8 664 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHDHQ9UQ10 334 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLXNB1O43157 2135 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL4A1P02462 1669 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDHXO00330 501 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 EBAG9O00559 213 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A17O43808 307 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGSF3O75054 1194 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 DFFBO76075 338 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV2-8P01709 118 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT19P08727 400 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRD5A1P18405 259 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKAP5P24588 427 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TGFBR1P36897 503 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 P2RY4P51582 365 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 THOP1P52888 689 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A1P53007 311 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 GALCP54803 685 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSNK2BP67870 215 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 FMODQ06828 376 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
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RNU6-172P-201ENST00000411000 GXYLT1Q4G148 440 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGAP6Q5VW22 663 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD40Q6AI12 368 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTFR2Q6P444 385 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMBQ6PCB8 327 aa-1.22□□□□□ -2.6
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RNU6-172P-201ENST00000411000 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4N4Q8N0Y3 316 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 FTMTQ8N4E7 242 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2CD4CQ8TF44 421 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC22A18Q96BI1 424 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 NECTIN4Q96NY8 510 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC1Q99614 292 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNN2Q9H2S1 579 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB26Q9HCK0 441 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBN1Q9NPG3 1134 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMOD4Q9NZQ9 345 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D29Q9UFV1 150 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITGA11Q9UKX5 1188 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC12A4Q9UP95 1085 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNG2Q9Y698 323 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 STON1Q9Y6Q2 735 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC16AO15027 2179 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0G2JN53 185 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A18PA6NE21 464 aa-1.23□□□□□ -2.61
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