RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 LOC285556D6RIA3 1793 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 DOCK5Q9H7D0 1870 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 TEX28O15482 410 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PRAMEF11O60813 436 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 FMO4P31512 558 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 RGS4P49798 205 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 MXD1Q05195 221 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 MAP2K5Q13163 448 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 IL18Q14116 193 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 GPR65Q8IYL9 337 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 OR2T12Q8NG77 320 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 FCGR1BQ92637 280 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 MALT1Q9UDY8 824 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 A8MU76 341 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 ABCB7O75027 752 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SNX4O95219 450 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 GSTM1P09488 218 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 ITGB6P18564 788 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PPIBP23284 216 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRD-205ENST00000397611 GSTM2P28161 218 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 ACLYP53396 1101 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 HUNKP57058 714 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SCN1BQ07699 218 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PON2Q15165 354 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 BTBD16Q32M84 506 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 TPRG1LQ5T0D9 272 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 CEP97Q8IW35 865 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 MYLPFQ96A32 169 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 NACC2Q96BF6 587 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 OCEL1Q9H607 264 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 ELP3Q9H9T3 547 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 NT5MQ9NPB1 228 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PARP14Q460N5 1801 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SLC22A1O15245 554 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SEC14L2O76054 403 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 MYL12AP19105 171 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 ELK4P28324 431 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 VBP1P61758 197 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PPP2R2BQ00005 443 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 CLCQ05315 142 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRD-205ENST00000397611 DSC1Q08554 894 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 ATG9BQ674R7 924 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 IKBIPQ70UQ0 350 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 STARD8Q92502 1023 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 CGREF1Q99674 301 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 CMTM6Q9NX76 183 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 EFCAB9A8MZ26 197 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRD-205ENST00000397611 CLDN11O75508 207 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SERPIND1P05546 499 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PCSK6P29122 969 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 DPP6P42658 865 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRD-205ENST00000397611 KRT74Q7RTS7 529 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRD-205ENST00000397611 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRD-205ENST00000397611 ACVR1CQ8NER5 493 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SOCS4Q8WXH5 440 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 PIK3R3Q92569 461 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 BHMTQ93088 406 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SLCO4A1Q96BD0 722 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 VPS35Q96QK1 796 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-205ENST00000397611 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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