RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 ENTPD5O75356 428 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PRKCHP24723 683 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 GATMP50440 423 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 KCT2Q8NC54 265 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SNX33Q8WV41 574 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ACSS2Q9NR19 701 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 A0A1W2PRB8 838 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 VSTM5A8MXK1 200 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 CLDN7O95471 211 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 GDF10P55107 478 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF33AQ06730 810 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ANKRD46Q86W74 232 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 OR2T3Q8NH03 318 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SLC35B2Q8TB61 432 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 KRT36O76013 467 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 CYB5AP00167 134 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 CBSLP0DN79 551 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF823P16415 610 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 CBSP35520 551 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF460Q14592 562 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 RNF31Q96EP0 1072 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM109Q9BVC6 243 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PIRO00625 290 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 JMJD7P0C870 316 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PTPN5P54829 565 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF280BQ86YH2 543 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SLC13A3Q8WWT9 602 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 DGAT2Q96PD7 388 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 VPS29Q9UBQ0 182 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SNED1Q8TER0 1413 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 LAMTOR5O43504 91 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 AGR2O95994 175 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PLGLB1Q02325 96 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 OLFML1Q6UWY5 402 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SPPL2CQ8IUH8 684 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PYCR2Q96C36 320 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SLC32A1Q9H598 525 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 DGKBQ9Y6T7 804 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRO-202ENST00000348962 TULP2O00295 520 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 AHCYP23526 432 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 VEGFBP49765 207 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 NR1H2P55055 460 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 OR4C6Q8NH72 309 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 NCSTNQ92542 709 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CRELD1Q96HD1 420 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 OR51F1A6NGY5 319 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ASNA1O43681 348 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 HLA-EP13747 358 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PRPS1L1P21108 318 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PDK3Q15120 406 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC66Q68CR7 880 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF527Q8NB42 609 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RAB7BQ96AH8 199 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 MPP4Q96JB8 637 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 KXD1Q9BQD3 176 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ALG2Q9H553 416 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 KCNK6Q9Y257 313 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 A0A0G2JN53 185 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 GRID2O43424 1007 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 OAS1P00973 400 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 IGFBP5P24593 272 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ATP1A4Q13733 1029 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF846Q147U1 533 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 IFI44LQ53G44 452 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RFKQ969G6 155 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ROPN1LQ96C74 230 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms