RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PREBQ9HCU5 417 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMCX1Q9P291 453 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ATXN10Q9UBB4 475 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE10AQ9Y233 779 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PQU0 124 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MGAT4DA6NG13 374 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM233B4DJY2 109 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EPI3 171 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 E2F3O00716 465 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP6CO00743 305 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 UBDO15205 165 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DCXO43602 365 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MATN4O95460 622 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PCCBP05166 539 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 THRAP10827 490 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GGT5P36269 586 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM23P36406 574 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNG1P51959 295 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 BTKQ06187 659 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GTF2H2Q13888 395 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 INPP5AQ14642 412 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 AGAP11Q8TF27 550 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB12Q8WXK4 309 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DLG3Q92796 817 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ESAMQ96AP7 390 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM131CQ96AQ9 280 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 COX14Q96I36 57 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC138Q96M89 665 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52B2Q96RD2 323 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR26Q9H7D7 661 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 IPPKQ9H8X2 491 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR23AA6NEV1 266 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC72A6NJI9 287 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 B2RBV5 119 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SDHDO14521 159 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GYG2O15488 501 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TAPBPO15533 448 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ13O60928 360 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FOSL2P15408 326 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDX6P30041 224 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEA9P43362 315 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPA7P48741 367 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DGKEP52429 567 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP8P85298 464 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK3Q00526 305 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RPA4Q13156 261 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CCINQ13939 588 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KANK2Q63ZY3 851 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ASRGL1Q7L266 308 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 AMZ2Q86W34 360 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 VRK3Q8IV63 474 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DDIASQ8IXT1 998 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PELI3Q8N2H9 469 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2L2Q8NH16 312 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL6Q8TCB7 284 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf60Q96EN9 201 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms