RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 OR6C65A6NJZ3 312 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HSD11B1P28845 292 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 BCAT1P54687 386 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RIOX2Q8IUF8 465 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ITGA10O75578 1167 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HSPA14Q0VDF9 509 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 KLHL22Q53GT1 634 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF367Q7RTV3 350 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 C2orf69Q8N8R5 385 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC22A8Q8TCC7 542 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF670Q9BS34 389 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LILRB5O75023 590 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 AKAP3O75969 853 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FMO3P31513 532 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 COQ3Q9NZJ6 369 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MT-CO2P00403 227 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB39AQ14964 217 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 GUK1Q16774 197 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TCF25Q9BQ70 676 aa11□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CD6P30203 668 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CRY1Q16526 586 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RETSATQ6NUM9 610 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CPB2Q96IY4 423 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CEP41Q9BYV8 373 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ACTR10Q9NZ32 417 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SH2B3Q9UQQ2 575 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CAPN3P20807 821 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 C8orf48Q96LL4 319 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MGAT4CQ9UBM8 478 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ITGAVP06756 1048 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ITGA2BP08514 1039 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TPRG1LQ5T0D9 272 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM209Q96SK2 561 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TACSTD2P09758 323 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CHRNB2P17787 502 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 USP29Q9HBJ7 922 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00032P0C843 101 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CDK2P24941 298 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HCN3Q9P1Z3 774 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP8B1Q9UNU6 501 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RCCD1A6NED2 376 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TTLL8A6PVC2 850 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 JCHAINP01591 159 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 UCHL1P09936 223 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CHAF1BQ13112 559 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 UGT8Q16880 541 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OR7G1Q8NGA0 311 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TEAD4Q15561 434 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OR52J3Q8NH60 311 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HEPHQ9BQS7 1158 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR45Q9Y484 360 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKRD36A6QL64 1941 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 EFCAB7A8K855 629 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 WASH3PC4AMC7 463 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF423Q2M1K9 1284 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OR6K6Q8NGW6 343 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 AGAP2Q99490 1192 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 BRINP2Q9C0B6 783 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 KLK14Q9P0G3 267 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1B0GV50 99 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SFTPBP07988 381 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 NUP54Q7Z3B4 507 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR149Q86SP6 731 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MITD1Q8WV92 249 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CDH22Q9UJ99 828 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CDH10Q9Y6N8 788 aa10.99□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 URADA6NGE7 173 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CHADO15335 359 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP2C18P33260 490 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 IER5Q5VY09 327 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CD320Q9NPF0 282 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CKBP12277 381 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ERVK-25P63136 954 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms