RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.49■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TRAPPC4Q9Y296 219 aa21.49■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 CKBP12277 381 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MLNP12872 115 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ZNF250P15622 560 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 PGAM1P18669 254 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MAP2K4P45985 399 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 LIMK2P53671 638 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 OLR1P78380 273 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MVKQ03426 396 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 PSMD5Q16401 504 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 CASC4Q6P4E1 433 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 BRAT1Q6PJG6 821 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 CMTM6Q9NX76 183 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TMEM233B4DJY2 109 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 METTL18O95568 372 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 GOT1P17174 413 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TGFBR2P37173 567 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ATP4BP51164 291 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 BTBD16Q32M84 506 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 PAF1Q8N7H5 531 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 PJA1Q8NG27 643 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 NT5C3BQ969T7 300 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 SCYL1Q96KG9 808 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 CDADC1Q9BWV3 514 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 USP3Q9Y6I4 520 aa21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 B3GAT3O94766 335 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 LRIG2O94898 1065 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ITGB1P05556 798 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TCF3P15923 654 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 RFX2P48378 723 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 CLK1P49759 484 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 SLC12A2P55011 1212 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ARPP19P56211 112 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 CD83Q01151 205 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 DGCR6Q14129 220 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TRIM60Q495X7 471 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 PYCR3Q53H96 274 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 SPANXN2Q5MJ10 180 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 BNIPLQ7Z465 357 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 NETO2Q8NC67 525 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 FBXW5Q969U6 566 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MSANTD3Q96H12 275 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 NPY6RQ99463 290 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ERVK-18Q9QC07 812 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 C1QBP02746 253 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 C2P06681 752 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 CD36P16671 472 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 FSHRP23945 695 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 BLVRAP53004 296 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 UBE3AQ05086 875 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 STK32CQ86UX6 486 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 FBLIM1Q8WUP2 373 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ASIC4Q96FT7 647 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MEAF6Q9HAF1 191 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 FANCFQ9NPI8 374 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MAP10Q9P2G4 905 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 FZD10Q9ULW2 581 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TSC2P49815 1807 aa21.47■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 NPHS1O60500 1241 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 OR5F1O95221 314 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 HMGN1P05114 100 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 SBK3P0C264 359 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ADORA3P0DMS8 318 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MSH3P20585 1137 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 RYKP34925 604 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 HMGCLP35914 325 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MICU2Q8IYU8 434 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 TMBIM1Q969X1 311 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 LRCH3Q96II8 777 aa21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PITX1-201ENST00000265340 MCCC2Q9HCC0 563 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms